Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm2035J3QP87 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm2035J3QP87 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm2035J3QP87 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm2035J3QP87 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm2035J3QP87 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm2035J3QP87 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm2035J3QP87 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm2035J3QP87 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm2035J3QP87 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm2035J3QP87 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm2035J3QP87 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm2035J3QP87 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm2035J3QP87 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm2035J3QP87 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm2035J3QP87 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm2035J3QP87 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm2035J3QP87 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm2035J3QP87 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm2035J3QP87 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm2035J3QP87 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm2035J3QP87 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm2035J3QP87 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm2035J3QP87 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm2035J3QP87 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm2035J3QP87 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm2035J3QP87 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm2035J3QP87 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm2035J3QP87 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm2035J3QP87 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm2035J3QP87 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm2035J3QP87 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm2035J3QP87 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm2035J3QP87 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm2035J3QP87 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm2035J3QP87 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm2035J3QP87 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm2035J3QP87 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm2035J3QP87 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm2035J3QP87 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm2035J3QP87 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm2035J3QP87 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm2035J3QP87 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm2035J3QP87 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm2035J3QP87 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm2035J3QP87 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm2035J3QP87 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm2035J3QP87 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm2035J3QP87 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm2035J3QP87 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm2035J3QP87 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm2035J3QP87 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm2035J3QP87 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm2035J3QP87 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm2035J3QP87 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm2035J3QP87 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm2035J3QP87 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm2035J3QP87 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm2035J3QP87 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm2035J3QP87 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm2035J3QP87 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm2035J3QP87 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm2035J3QP87 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm2035J3QP87 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm2035J3QP87 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm2035J3QP87 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm2035J3QP87 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm2035J3QP87 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm2035J3QP87 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm2035J3QP87 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm2035J3QP87 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm2035J3QP87 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm2035J3QP87 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm2035J3QP87 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm2035J3QP87 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm2035J3QP87 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm2035J3QP87 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm2035J3QP87 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm2035J3QP87 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm2035J3QP87 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm2035J3QP87 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm2035J3QP87 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm2035J3QP87 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm2035J3QP87 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm2035J3QP87 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm2035J3QP87 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm2035J3QP87 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm2035J3QP87 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm2035J3QP87 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm2035J3QP87 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm2035J3QP87 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm2035J3QP87 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm2035J3QP87 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm2035J3QP87 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm2035J3QP87 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm2035J3QP87 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm2035J3QP87 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm2035J3QP87 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm2035J3QP87 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm2035J3QP87 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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