Protein–RNA interactions for Protein: J3QNV7

Gm10428, Predicted gene 10428, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10428J3QNV7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm10428J3QNV7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm10428J3QNV7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm10428J3QNV7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm10428J3QNV7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm10428J3QNV7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm10428J3QNV7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm10428J3QNV7 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm10428J3QNV7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm10428J3QNV7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm10428J3QNV7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm10428J3QNV7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm10428J3QNV7 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm10428J3QNV7 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm10428J3QNV7 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm10428J3QNV7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Gm10428J3QNV7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm10428J3QNV7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm10428J3QNV7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm10428J3QNV7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm10428J3QNV7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm10428J3QNV7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm10428J3QNV7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm10428J3QNV7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Gm10428J3QNV7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm10428J3QNV7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm10428J3QNV7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm10428J3QNV7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm10428J3QNV7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Gm10428J3QNV7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm10428J3QNV7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Gm10428J3QNV7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm10428J3QNV7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm10428J3QNV7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm10428J3QNV7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm10428J3QNV7 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm10428J3QNV7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Gm10428J3QNV7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm10428J3QNV7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm10428J3QNV7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm10428J3QNV7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm10428J3QNV7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm10428J3QNV7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm10428J3QNV7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Gm10428J3QNV7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Gm10428J3QNV7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Gm10428J3QNV7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm10428J3QNV7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Gm10428J3QNV7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Gm10428J3QNV7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Gm10428J3QNV7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Gm10428J3QNV7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm10428J3QNV7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm10428J3QNV7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm10428J3QNV7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm10428J3QNV7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm10428J3QNV7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm10428J3QNV7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm10428J3QNV7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm10428J3QNV7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm10428J3QNV7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm10428J3QNV7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm10428J3QNV7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm10428J3QNV7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm10428J3QNV7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm10428J3QNV7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm10428J3QNV7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm10428J3QNV7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm10428J3QNV7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm10428J3QNV7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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