Protein–RNA interactions for Protein: J3QMW5

Gm2075, Predicted gene 2075, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2075J3QMW5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm2075J3QMW5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm2075J3QMW5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm2075J3QMW5 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm2075J3QMW5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm2075J3QMW5 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm2075J3QMW5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm2075J3QMW5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm2075J3QMW5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm2075J3QMW5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm2075J3QMW5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm2075J3QMW5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm2075J3QMW5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm2075J3QMW5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm2075J3QMW5 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm2075J3QMW5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm2075J3QMW5 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm2075J3QMW5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm2075J3QMW5 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm2075J3QMW5 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm2075J3QMW5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm2075J3QMW5 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm2075J3QMW5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm2075J3QMW5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm2075J3QMW5 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm2075J3QMW5 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm2075J3QMW5 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm2075J3QMW5 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm2075J3QMW5 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm2075J3QMW5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm2075J3QMW5 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm2075J3QMW5 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm2075J3QMW5 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm2075J3QMW5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm2075J3QMW5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm2075J3QMW5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm2075J3QMW5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm2075J3QMW5 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm2075J3QMW5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm2075J3QMW5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm2075J3QMW5 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm2075J3QMW5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm2075J3QMW5 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm2075J3QMW5 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm2075J3QMW5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm2075J3QMW5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm2075J3QMW5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm2075J3QMW5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm2075J3QMW5 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm2075J3QMW5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm2075J3QMW5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm2075J3QMW5 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm2075J3QMW5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm2075J3QMW5 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm2075J3QMW5 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm2075J3QMW5 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm2075J3QMW5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm2075J3QMW5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm2075J3QMW5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm2075J3QMW5 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm2075J3QMW5 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm2075J3QMW5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm2075J3QMW5 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm2075J3QMW5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm2075J3QMW5 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm2075J3QMW5 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm2075J3QMW5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm2075J3QMW5 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm2075J3QMW5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm2075J3QMW5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm2075J3QMW5 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm2075J3QMW5 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm2075J3QMW5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm2075J3QMW5 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm2075J3QMW5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm2075J3QMW5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm2075J3QMW5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm2075J3QMW5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm2075J3QMW5 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm2075J3QMW5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm2075J3QMW5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm2075J3QMW5 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm2075J3QMW5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm2075J3QMW5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm2075J3QMW5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm2075J3QMW5 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm2075J3QMW5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm2075J3QMW5 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm2075J3QMW5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm2075J3QMW5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm2075J3QMW5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm2075J3QMW5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm2075J3QMW5 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm2075J3QMW5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm2075J3QMW5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm2075J3QMW5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm2075J3QMW5 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm2075J3QMW5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm2075J3QMW5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm2075J3QMW5 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms