Protein–RNA interactions for Protein: G5E829

Atp2b1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b1G5E829 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Atp2b1G5E829 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp2b1G5E829 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp2b1G5E829 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp2b1G5E829 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Atp2b1G5E829 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp2b1G5E829 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp2b1G5E829 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp2b1G5E829 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp2b1G5E829 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp2b1G5E829 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp2b1G5E829 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp2b1G5E829 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp2b1G5E829 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp2b1G5E829 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp2b1G5E829 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp2b1G5E829 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp2b1G5E829 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp2b1G5E829 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp2b1G5E829 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp2b1G5E829 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp2b1G5E829 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp2b1G5E829 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp2b1G5E829 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp2b1G5E829 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp2b1G5E829 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp2b1G5E829 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp2b1G5E829 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp2b1G5E829 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp2b1G5E829 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp2b1G5E829 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp2b1G5E829 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp2b1G5E829 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp2b1G5E829 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp2b1G5E829 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp2b1G5E829 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp2b1G5E829 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp2b1G5E829 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Atp2b1G5E829 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp2b1G5E829 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp2b1G5E829 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp2b1G5E829 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp2b1G5E829 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp2b1G5E829 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp2b1G5E829 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp2b1G5E829 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp2b1G5E829 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp2b1G5E829 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp2b1G5E829 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp2b1G5E829 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp2b1G5E829 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp2b1G5E829 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp2b1G5E829 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp2b1G5E829 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp2b1G5E829 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp2b1G5E829 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp2b1G5E829 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp2b1G5E829 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp2b1G5E829 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp2b1G5E829 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp2b1G5E829 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp2b1G5E829 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp2b1G5E829 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp2b1G5E829 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp2b1G5E829 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp2b1G5E829 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp2b1G5E829 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp2b1G5E829 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp2b1G5E829 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp2b1G5E829 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp2b1G5E829 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp2b1G5E829 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp2b1G5E829 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp2b1G5E829 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp2b1G5E829 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp2b1G5E829 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp2b1G5E829 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp2b1G5E829 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp2b1G5E829 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp2b1G5E829 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp2b1G5E829 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp2b1G5E829 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp2b1G5E829 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp2b1G5E829 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp2b1G5E829 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp2b1G5E829 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp2b1G5E829 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp2b1G5E829 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp2b1G5E829 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp2b1G5E829 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp2b1G5E829 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp2b1G5E829 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp2b1G5E829 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp2b1G5E829 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp2b1G5E829 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp2b1G5E829 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp2b1G5E829 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp2b1G5E829 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp2b1G5E829 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp2b1G5E829 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms