Protein–RNA interactions for Protein: G3X9M3

Hmgxb3, HMG box domain-containing 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgxb3G3X9M3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hmgxb3G3X9M3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hmgxb3G3X9M3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hmgxb3G3X9M3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hmgxb3G3X9M3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hmgxb3G3X9M3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hmgxb3G3X9M3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hmgxb3G3X9M3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hmgxb3G3X9M3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hmgxb3G3X9M3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hmgxb3G3X9M3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hmgxb3G3X9M3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hmgxb3G3X9M3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hmgxb3G3X9M3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hmgxb3G3X9M3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hmgxb3G3X9M3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hmgxb3G3X9M3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hmgxb3G3X9M3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hmgxb3G3X9M3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hmgxb3G3X9M3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hmgxb3G3X9M3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hmgxb3G3X9M3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hmgxb3G3X9M3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hmgxb3G3X9M3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hmgxb3G3X9M3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hmgxb3G3X9M3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hmgxb3G3X9M3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hmgxb3G3X9M3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hmgxb3G3X9M3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hmgxb3G3X9M3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hmgxb3G3X9M3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hmgxb3G3X9M3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Hmgxb3G3X9M3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hmgxb3G3X9M3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Hmgxb3G3X9M3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hmgxb3G3X9M3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hmgxb3G3X9M3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hmgxb3G3X9M3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hmgxb3G3X9M3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hmgxb3G3X9M3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hmgxb3G3X9M3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hmgxb3G3X9M3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hmgxb3G3X9M3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hmgxb3G3X9M3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hmgxb3G3X9M3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hmgxb3G3X9M3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hmgxb3G3X9M3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hmgxb3G3X9M3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hmgxb3G3X9M3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hmgxb3G3X9M3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hmgxb3G3X9M3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hmgxb3G3X9M3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hmgxb3G3X9M3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hmgxb3G3X9M3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hmgxb3G3X9M3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hmgxb3G3X9M3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hmgxb3G3X9M3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hmgxb3G3X9M3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hmgxb3G3X9M3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hmgxb3G3X9M3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hmgxb3G3X9M3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hmgxb3G3X9M3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hmgxb3G3X9M3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hmgxb3G3X9M3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hmgxb3G3X9M3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hmgxb3G3X9M3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Hmgxb3G3X9M3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hmgxb3G3X9M3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hmgxb3G3X9M3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hmgxb3G3X9M3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hmgxb3G3X9M3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hmgxb3G3X9M3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hmgxb3G3X9M3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Hmgxb3G3X9M3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hmgxb3G3X9M3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hmgxb3G3X9M3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hmgxb3G3X9M3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hmgxb3G3X9M3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hmgxb3G3X9M3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hmgxb3G3X9M3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hmgxb3G3X9M3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hmgxb3G3X9M3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hmgxb3G3X9M3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hmgxb3G3X9M3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hmgxb3G3X9M3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hmgxb3G3X9M3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hmgxb3G3X9M3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hmgxb3G3X9M3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hmgxb3G3X9M3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hmgxb3G3X9M3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hmgxb3G3X9M3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hmgxb3G3X9M3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hmgxb3G3X9M3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hmgxb3G3X9M3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hmgxb3G3X9M3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hmgxb3G3X9M3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hmgxb3G3X9M3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hmgxb3G3X9M3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hmgxb3G3X9M3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hmgxb3G3X9M3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms