Protein–RNA interactions for Protein: E9QA15

Cald1, Caldesmon 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cald1E9QA15 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cald1E9QA15 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cald1E9QA15 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cald1E9QA15 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cald1E9QA15 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cald1E9QA15 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cald1E9QA15 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cald1E9QA15 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cald1E9QA15 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cald1E9QA15 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cald1E9QA15 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cald1E9QA15 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cald1E9QA15 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cald1E9QA15 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cald1E9QA15 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Cald1E9QA15 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cald1E9QA15 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cald1E9QA15 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cald1E9QA15 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cald1E9QA15 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cald1E9QA15 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cald1E9QA15 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cald1E9QA15 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cald1E9QA15 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cald1E9QA15 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cald1E9QA15 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cald1E9QA15 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cald1E9QA15 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cald1E9QA15 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cald1E9QA15 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cald1E9QA15 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cald1E9QA15 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cald1E9QA15 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cald1E9QA15 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cald1E9QA15 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cald1E9QA15 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cald1E9QA15 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cald1E9QA15 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Cald1E9QA15 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Cald1E9QA15 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cald1E9QA15 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cald1E9QA15 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cald1E9QA15 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cald1E9QA15 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cald1E9QA15 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cald1E9QA15 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cald1E9QA15 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cald1E9QA15 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cald1E9QA15 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cald1E9QA15 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cald1E9QA15 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cald1E9QA15 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cald1E9QA15 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Cald1E9QA15 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cald1E9QA15 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cald1E9QA15 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cald1E9QA15 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cald1E9QA15 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cald1E9QA15 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cald1E9QA15 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cald1E9QA15 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cald1E9QA15 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cald1E9QA15 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cald1E9QA15 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cald1E9QA15 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cald1E9QA15 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cald1E9QA15 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cald1E9QA15 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cald1E9QA15 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cald1E9QA15 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cald1E9QA15 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cald1E9QA15 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cald1E9QA15 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cald1E9QA15 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cald1E9QA15 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cald1E9QA15 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cald1E9QA15 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cald1E9QA15 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cald1E9QA15 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cald1E9QA15 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cald1E9QA15 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cald1E9QA15 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cald1E9QA15 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cald1E9QA15 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cald1E9QA15 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cald1E9QA15 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cald1E9QA15 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cald1E9QA15 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cald1E9QA15 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cald1E9QA15 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cald1E9QA15 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cald1E9QA15 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cald1E9QA15 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cald1E9QA15 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cald1E9QA15 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cald1E9QA15 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cald1E9QA15 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cald1E9QA15 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cald1E9QA15 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cald1E9QA15 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms