Protein–RNA interactions for Protein: E9Q355

Catsperg1, Cation channel sperm-associated protein subunit gamma 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsperg1E9Q355 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Catsperg1E9Q355 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Catsperg1E9Q355 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Catsperg1E9Q355 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Catsperg1E9Q355 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Catsperg1E9Q355 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Catsperg1E9Q355 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Catsperg1E9Q355 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Catsperg1E9Q355 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Catsperg1E9Q355 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Catsperg1E9Q355 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Catsperg1E9Q355 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Catsperg1E9Q355 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Catsperg1E9Q355 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Catsperg1E9Q355 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Catsperg1E9Q355 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Catsperg1E9Q355 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Catsperg1E9Q355 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Catsperg1E9Q355 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Catsperg1E9Q355 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Catsperg1E9Q355 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Catsperg1E9Q355 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Catsperg1E9Q355 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Catsperg1E9Q355 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Catsperg1E9Q355 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Catsperg1E9Q355 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Catsperg1E9Q355 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Catsperg1E9Q355 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Catsperg1E9Q355 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Catsperg1E9Q355 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Catsperg1E9Q355 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Catsperg1E9Q355 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Catsperg1E9Q355 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Catsperg1E9Q355 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Catsperg1E9Q355 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Catsperg1E9Q355 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Catsperg1E9Q355 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Catsperg1E9Q355 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Catsperg1E9Q355 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Catsperg1E9Q355 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Catsperg1E9Q355 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Catsperg1E9Q355 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Catsperg1E9Q355 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Catsperg1E9Q355 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Catsperg1E9Q355 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Catsperg1E9Q355 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Catsperg1E9Q355 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Catsperg1E9Q355 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Catsperg1E9Q355 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Catsperg1E9Q355 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Catsperg1E9Q355 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Catsperg1E9Q355 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Catsperg1E9Q355 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Catsperg1E9Q355 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Catsperg1E9Q355 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Catsperg1E9Q355 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Catsperg1E9Q355 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Catsperg1E9Q355 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Catsperg1E9Q355 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Catsperg1E9Q355 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Catsperg1E9Q355 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Catsperg1E9Q355 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Catsperg1E9Q355 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Catsperg1E9Q355 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Catsperg1E9Q355 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Catsperg1E9Q355 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Catsperg1E9Q355 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Catsperg1E9Q355 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Catsperg1E9Q355 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Catsperg1E9Q355 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Catsperg1E9Q355 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Catsperg1E9Q355 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Catsperg1E9Q355 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Catsperg1E9Q355 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Catsperg1E9Q355 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Catsperg1E9Q355 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Catsperg1E9Q355 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Catsperg1E9Q355 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Catsperg1E9Q355 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Catsperg1E9Q355 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Catsperg1E9Q355 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Catsperg1E9Q355 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Catsperg1E9Q355 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Catsperg1E9Q355 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Catsperg1E9Q355 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Catsperg1E9Q355 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Catsperg1E9Q355 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Catsperg1E9Q355 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Catsperg1E9Q355 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Catsperg1E9Q355 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Catsperg1E9Q355 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Catsperg1E9Q355 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Catsperg1E9Q355 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Catsperg1E9Q355 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Catsperg1E9Q355 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Catsperg1E9Q355 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Catsperg1E9Q355 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Catsperg1E9Q355 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Catsperg1E9Q355 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Catsperg1E9Q355 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms