Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt78E9Q0F0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt78E9Q0F0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt78E9Q0F0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt78E9Q0F0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt78E9Q0F0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt78E9Q0F0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt78E9Q0F0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt78E9Q0F0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt78E9Q0F0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt78E9Q0F0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt78E9Q0F0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt78E9Q0F0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt78E9Q0F0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt78E9Q0F0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt78E9Q0F0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt78E9Q0F0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt78E9Q0F0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt78E9Q0F0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt78E9Q0F0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt78E9Q0F0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt78E9Q0F0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt78E9Q0F0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt78E9Q0F0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt78E9Q0F0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt78E9Q0F0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt78E9Q0F0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt78E9Q0F0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt78E9Q0F0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt78E9Q0F0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt78E9Q0F0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt78E9Q0F0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt78E9Q0F0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt78E9Q0F0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt78E9Q0F0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt78E9Q0F0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt78E9Q0F0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt78E9Q0F0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt78E9Q0F0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt78E9Q0F0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt78E9Q0F0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt78E9Q0F0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt78E9Q0F0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt78E9Q0F0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt78E9Q0F0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt78E9Q0F0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt78E9Q0F0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt78E9Q0F0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt78E9Q0F0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt78E9Q0F0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt78E9Q0F0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt78E9Q0F0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt78E9Q0F0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt78E9Q0F0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt78E9Q0F0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt78E9Q0F0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt78E9Q0F0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt78E9Q0F0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt78E9Q0F0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt78E9Q0F0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt78E9Q0F0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt78E9Q0F0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt78E9Q0F0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt78E9Q0F0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt78E9Q0F0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt78E9Q0F0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt78E9Q0F0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt78E9Q0F0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt78E9Q0F0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt78E9Q0F0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt78E9Q0F0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt78E9Q0F0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Krt78E9Q0F0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt78E9Q0F0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt78E9Q0F0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt78E9Q0F0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt78E9Q0F0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt78E9Q0F0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt78E9Q0F0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt78E9Q0F0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt78E9Q0F0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt78E9Q0F0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt78E9Q0F0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt78E9Q0F0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt78E9Q0F0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt78E9Q0F0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt78E9Q0F0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt78E9Q0F0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt78E9Q0F0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt78E9Q0F0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt78E9Q0F0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt78E9Q0F0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt78E9Q0F0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt78E9Q0F0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt78E9Q0F0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt78E9Q0F0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt78E9Q0F0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt78E9Q0F0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt78E9Q0F0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt78E9Q0F0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms