Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ0

Ryr1, Ryanodine receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 5,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ryr1E9PZQ0 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ryr1E9PZQ0 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ryr1E9PZQ0 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ryr1E9PZQ0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ryr1E9PZQ0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ryr1E9PZQ0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ryr1E9PZQ0 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ryr1E9PZQ0 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ryr1E9PZQ0 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ryr1E9PZQ0 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Ryr1E9PZQ0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ryr1E9PZQ0 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ryr1E9PZQ0 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ryr1E9PZQ0 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ryr1E9PZQ0 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ryr1E9PZQ0 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ryr1E9PZQ0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ryr1E9PZQ0 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ryr1E9PZQ0 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ryr1E9PZQ0 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ryr1E9PZQ0 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Ryr1E9PZQ0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ryr1E9PZQ0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ryr1E9PZQ0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ryr1E9PZQ0 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ryr1E9PZQ0 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ryr1E9PZQ0 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ryr1E9PZQ0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ryr1E9PZQ0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ryr1E9PZQ0 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ryr1E9PZQ0 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ryr1E9PZQ0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ryr1E9PZQ0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ryr1E9PZQ0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ryr1E9PZQ0 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ryr1E9PZQ0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ryr1E9PZQ0 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ryr1E9PZQ0 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Ryr1E9PZQ0 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Ryr1E9PZQ0 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ryr1E9PZQ0 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ryr1E9PZQ0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ryr1E9PZQ0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ryr1E9PZQ0 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ryr1E9PZQ0 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ryr1E9PZQ0 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ryr1E9PZQ0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ryr1E9PZQ0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ryr1E9PZQ0 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ryr1E9PZQ0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ryr1E9PZQ0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ryr1E9PZQ0 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ryr1E9PZQ0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ryr1E9PZQ0 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ryr1E9PZQ0 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ryr1E9PZQ0 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ryr1E9PZQ0 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ryr1E9PZQ0 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ryr1E9PZQ0 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ryr1E9PZQ0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ryr1E9PZQ0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ryr1E9PZQ0 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ryr1E9PZQ0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ryr1E9PZQ0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ryr1E9PZQ0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ryr1E9PZQ0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ryr1E9PZQ0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ryr1E9PZQ0 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ryr1E9PZQ0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ryr1E9PZQ0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ryr1E9PZQ0 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ryr1E9PZQ0 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Ryr1E9PZQ0 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Ryr1E9PZQ0 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Ryr1E9PZQ0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ryr1E9PZQ0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ryr1E9PZQ0 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ryr1E9PZQ0 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Ryr1E9PZQ0 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ryr1E9PZQ0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ryr1E9PZQ0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ryr1E9PZQ0 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ryr1E9PZQ0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ryr1E9PZQ0 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ryr1E9PZQ0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ryr1E9PZQ0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ryr1E9PZQ0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ryr1E9PZQ0 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ryr1E9PZQ0 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ryr1E9PZQ0 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ryr1E9PZQ0 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ryr1E9PZQ0 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ryr1E9PZQ0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ryr1E9PZQ0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ryr1E9PZQ0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ryr1E9PZQ0 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ryr1E9PZQ0 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ryr1E9PZQ0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ryr1E9PZQ0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ryr1E9PZQ0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms