Protein–RNA interactions for Protein: E9PW72

Gm3002, Predicted gene 3002, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3002E9PW72 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm3002E9PW72 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm3002E9PW72 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm3002E9PW72 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm3002E9PW72 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm3002E9PW72 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm3002E9PW72 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm3002E9PW72 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm3002E9PW72 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm3002E9PW72 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm3002E9PW72 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm3002E9PW72 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm3002E9PW72 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm3002E9PW72 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm3002E9PW72 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm3002E9PW72 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm3002E9PW72 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm3002E9PW72 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm3002E9PW72 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm3002E9PW72 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm3002E9PW72 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm3002E9PW72 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm3002E9PW72 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm3002E9PW72 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm3002E9PW72 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm3002E9PW72 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm3002E9PW72 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm3002E9PW72 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm3002E9PW72 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm3002E9PW72 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm3002E9PW72 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm3002E9PW72 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm3002E9PW72 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm3002E9PW72 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm3002E9PW72 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm3002E9PW72 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3002E9PW72 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3002E9PW72 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3002E9PW72 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3002E9PW72 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3002E9PW72 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3002E9PW72 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3002E9PW72 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3002E9PW72 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3002E9PW72 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3002E9PW72 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm3002E9PW72 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm3002E9PW72 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm3002E9PW72 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm3002E9PW72 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm3002E9PW72 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm3002E9PW72 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm3002E9PW72 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm3002E9PW72 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm3002E9PW72 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm3002E9PW72 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm3002E9PW72 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm3002E9PW72 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm3002E9PW72 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm3002E9PW72 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm3002E9PW72 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3002E9PW72 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3002E9PW72 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3002E9PW72 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3002E9PW72 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3002E9PW72 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3002E9PW72 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3002E9PW72 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3002E9PW72 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3002E9PW72 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3002E9PW72 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3002E9PW72 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3002E9PW72 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3002E9PW72 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3002E9PW72 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3002E9PW72 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3002E9PW72 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3002E9PW72 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3002E9PW72 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3002E9PW72 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3002E9PW72 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3002E9PW72 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3002E9PW72 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3002E9PW72 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3002E9PW72 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3002E9PW72 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3002E9PW72 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3002E9PW72 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3002E9PW72 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3002E9PW72 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3002E9PW72 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3002E9PW72 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3002E9PW72 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3002E9PW72 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3002E9PW72 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3002E9PW72 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3002E9PW72 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3002E9PW72 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3002E9PW72 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3002E9PW72 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms