Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ttc17E9PVB5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ttc17E9PVB5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ttc17E9PVB5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ttc17E9PVB5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ttc17E9PVB5 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ttc17E9PVB5 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ttc17E9PVB5 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ttc17E9PVB5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ttc17E9PVB5 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ttc17E9PVB5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ttc17E9PVB5 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ttc17E9PVB5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ttc17E9PVB5 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ttc17E9PVB5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ttc17E9PVB5 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ttc17E9PVB5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ttc17E9PVB5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ttc17E9PVB5 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ttc17E9PVB5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ttc17E9PVB5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ttc17E9PVB5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ttc17E9PVB5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ttc17E9PVB5 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ttc17E9PVB5 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ttc17E9PVB5 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ttc17E9PVB5 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ttc17E9PVB5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ttc17E9PVB5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ttc17E9PVB5 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ttc17E9PVB5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ttc17E9PVB5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ttc17E9PVB5 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ttc17E9PVB5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ttc17E9PVB5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ttc17E9PVB5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ttc17E9PVB5 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ttc17E9PVB5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ttc17E9PVB5 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ttc17E9PVB5 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ttc17E9PVB5 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ttc17E9PVB5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ttc17E9PVB5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ttc17E9PVB5 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ttc17E9PVB5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ttc17E9PVB5 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ttc17E9PVB5 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ttc17E9PVB5 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ttc17E9PVB5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ttc17E9PVB5 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ttc17E9PVB5 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ttc17E9PVB5 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ttc17E9PVB5 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ttc17E9PVB5 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ttc17E9PVB5 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ttc17E9PVB5 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ttc17E9PVB5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ttc17E9PVB5 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ttc17E9PVB5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ttc17E9PVB5 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ttc17E9PVB5 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ttc17E9PVB5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ttc17E9PVB5 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ttc17E9PVB5 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ttc17E9PVB5 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ttc17E9PVB5 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ttc17E9PVB5 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ttc17E9PVB5 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ttc17E9PVB5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ttc17E9PVB5 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ttc17E9PVB5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ttc17E9PVB5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ttc17E9PVB5 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ttc17E9PVB5 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ttc17E9PVB5 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ttc17E9PVB5 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ttc17E9PVB5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ttc17E9PVB5 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ttc17E9PVB5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ttc17E9PVB5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ttc17E9PVB5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ttc17E9PVB5 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ttc17E9PVB5 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ttc17E9PVB5 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ttc17E9PVB5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ttc17E9PVB5 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ttc17E9PVB5 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ttc17E9PVB5 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ttc17E9PVB5 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ttc17E9PVB5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ttc17E9PVB5 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ttc17E9PVB5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ttc17E9PVB5 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ttc17E9PVB5 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ttc17E9PVB5 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ttc17E9PVB5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ttc17E9PVB5 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ttc17E9PVB5 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ttc17E9PVB5 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ttc17E9PVB5 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms