Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1D3

3425401B19Rik, RIKEN cDNA 3425401B19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3425401B19RikD3Z1D3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
3425401B19RikD3Z1D3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
3425401B19RikD3Z1D3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
3425401B19RikD3Z1D3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
3425401B19RikD3Z1D3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
3425401B19RikD3Z1D3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
3425401B19RikD3Z1D3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
3425401B19RikD3Z1D3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
3425401B19RikD3Z1D3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
3425401B19RikD3Z1D3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
3425401B19RikD3Z1D3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
3425401B19RikD3Z1D3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
3425401B19RikD3Z1D3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
3425401B19RikD3Z1D3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
3425401B19RikD3Z1D3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
3425401B19RikD3Z1D3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
3425401B19RikD3Z1D3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
3425401B19RikD3Z1D3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
3425401B19RikD3Z1D3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
3425401B19RikD3Z1D3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
3425401B19RikD3Z1D3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
3425401B19RikD3Z1D3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
3425401B19RikD3Z1D3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
3425401B19RikD3Z1D3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
3425401B19RikD3Z1D3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
3425401B19RikD3Z1D3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
3425401B19RikD3Z1D3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
3425401B19RikD3Z1D3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
3425401B19RikD3Z1D3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
3425401B19RikD3Z1D3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
3425401B19RikD3Z1D3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
3425401B19RikD3Z1D3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
3425401B19RikD3Z1D3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
3425401B19RikD3Z1D3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
3425401B19RikD3Z1D3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
3425401B19RikD3Z1D3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
3425401B19RikD3Z1D3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
3425401B19RikD3Z1D3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
3425401B19RikD3Z1D3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
3425401B19RikD3Z1D3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
3425401B19RikD3Z1D3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
3425401B19RikD3Z1D3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
3425401B19RikD3Z1D3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
3425401B19RikD3Z1D3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
3425401B19RikD3Z1D3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
3425401B19RikD3Z1D3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
3425401B19RikD3Z1D3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
3425401B19RikD3Z1D3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
3425401B19RikD3Z1D3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
3425401B19RikD3Z1D3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
3425401B19RikD3Z1D3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
3425401B19RikD3Z1D3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
3425401B19RikD3Z1D3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
3425401B19RikD3Z1D3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
3425401B19RikD3Z1D3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
3425401B19RikD3Z1D3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
3425401B19RikD3Z1D3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
3425401B19RikD3Z1D3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
3425401B19RikD3Z1D3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
3425401B19RikD3Z1D3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
3425401B19RikD3Z1D3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
3425401B19RikD3Z1D3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
3425401B19RikD3Z1D3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
3425401B19RikD3Z1D3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
3425401B19RikD3Z1D3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
3425401B19RikD3Z1D3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
3425401B19RikD3Z1D3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
3425401B19RikD3Z1D3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
3425401B19RikD3Z1D3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
3425401B19RikD3Z1D3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
3425401B19RikD3Z1D3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
3425401B19RikD3Z1D3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
3425401B19RikD3Z1D3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
3425401B19RikD3Z1D3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
3425401B19RikD3Z1D3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
3425401B19RikD3Z1D3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
3425401B19RikD3Z1D3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
3425401B19RikD3Z1D3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
3425401B19RikD3Z1D3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
3425401B19RikD3Z1D3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
3425401B19RikD3Z1D3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
3425401B19RikD3Z1D3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
3425401B19RikD3Z1D3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
3425401B19RikD3Z1D3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
3425401B19RikD3Z1D3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
3425401B19RikD3Z1D3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
3425401B19RikD3Z1D3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
3425401B19RikD3Z1D3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
3425401B19RikD3Z1D3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
3425401B19RikD3Z1D3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
3425401B19RikD3Z1D3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
3425401B19RikD3Z1D3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
3425401B19RikD3Z1D3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
3425401B19RikD3Z1D3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
3425401B19RikD3Z1D3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
3425401B19RikD3Z1D3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
3425401B19RikD3Z1D3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
3425401B19RikD3Z1D3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
3425401B19RikD3Z1D3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
3425401B19RikD3Z1D3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms