Protein–RNA interactions for Protein: D3YW29

Rexo5, RNA exonuclease 5, mousemouse

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo5D3YW29 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rexo5D3YW29 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rexo5D3YW29 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rexo5D3YW29 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rexo5D3YW29 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rexo5D3YW29 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rexo5D3YW29 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rexo5D3YW29 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rexo5D3YW29 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rexo5D3YW29 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rexo5D3YW29 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rexo5D3YW29 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rexo5D3YW29 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rexo5D3YW29 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rexo5D3YW29 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rexo5D3YW29 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rexo5D3YW29 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rexo5D3YW29 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rexo5D3YW29 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rexo5D3YW29 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rexo5D3YW29 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rexo5D3YW29 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rexo5D3YW29 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rexo5D3YW29 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rexo5D3YW29 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rexo5D3YW29 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rexo5D3YW29 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rexo5D3YW29 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Rexo5D3YW29 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rexo5D3YW29 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rexo5D3YW29 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rexo5D3YW29 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rexo5D3YW29 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rexo5D3YW29 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rexo5D3YW29 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rexo5D3YW29 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rexo5D3YW29 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rexo5D3YW29 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rexo5D3YW29 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rexo5D3YW29 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rexo5D3YW29 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rexo5D3YW29 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rexo5D3YW29 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rexo5D3YW29 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rexo5D3YW29 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rexo5D3YW29 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rexo5D3YW29 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rexo5D3YW29 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rexo5D3YW29 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rexo5D3YW29 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rexo5D3YW29 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rexo5D3YW29 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rexo5D3YW29 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rexo5D3YW29 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rexo5D3YW29 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rexo5D3YW29 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rexo5D3YW29 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rexo5D3YW29 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rexo5D3YW29 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rexo5D3YW29 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rexo5D3YW29 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rexo5D3YW29 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rexo5D3YW29 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rexo5D3YW29 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rexo5D3YW29 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rexo5D3YW29 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rexo5D3YW29 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rexo5D3YW29 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rexo5D3YW29 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rexo5D3YW29 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rexo5D3YW29 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rexo5D3YW29 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rexo5D3YW29 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rexo5D3YW29 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rexo5D3YW29 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rexo5D3YW29 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rexo5D3YW29 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rexo5D3YW29 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rexo5D3YW29 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rexo5D3YW29 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rexo5D3YW29 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rexo5D3YW29 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rexo5D3YW29 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rexo5D3YW29 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rexo5D3YW29 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rexo5D3YW29 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rexo5D3YW29 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rexo5D3YW29 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rexo5D3YW29 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rexo5D3YW29 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rexo5D3YW29 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rexo5D3YW29 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rexo5D3YW29 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rexo5D3YW29 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Rexo5D3YW29 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Rexo5D3YW29 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rexo5D3YW29 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rexo5D3YW29 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rexo5D3YW29 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rexo5D3YW29 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms