Protein–RNA interactions for Protein: D3YUM8

Gm4950, Proteasome subunit beta type, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4950D3YUM8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm4950D3YUM8 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm4950D3YUM8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm4950D3YUM8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm4950D3YUM8 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm4950D3YUM8 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm4950D3YUM8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm4950D3YUM8 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm4950D3YUM8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm4950D3YUM8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm4950D3YUM8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm4950D3YUM8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm4950D3YUM8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm4950D3YUM8 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm4950D3YUM8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm4950D3YUM8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm4950D3YUM8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm4950D3YUM8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm4950D3YUM8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm4950D3YUM8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm4950D3YUM8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm4950D3YUM8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm4950D3YUM8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm4950D3YUM8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm4950D3YUM8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm4950D3YUM8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gm4950D3YUM8 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gm4950D3YUM8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gm4950D3YUM8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm4950D3YUM8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm4950D3YUM8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm4950D3YUM8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm4950D3YUM8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm4950D3YUM8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm4950D3YUM8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm4950D3YUM8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm4950D3YUM8 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm4950D3YUM8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm4950D3YUM8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm4950D3YUM8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm4950D3YUM8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm4950D3YUM8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm4950D3YUM8 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm4950D3YUM8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm4950D3YUM8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm4950D3YUM8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm4950D3YUM8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm4950D3YUM8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm4950D3YUM8 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm4950D3YUM8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm4950D3YUM8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm4950D3YUM8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm4950D3YUM8 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm4950D3YUM8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm4950D3YUM8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm4950D3YUM8 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm4950D3YUM8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm4950D3YUM8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm4950D3YUM8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm4950D3YUM8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm4950D3YUM8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm4950D3YUM8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm4950D3YUM8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm4950D3YUM8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm4950D3YUM8 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm4950D3YUM8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm4950D3YUM8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm4950D3YUM8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm4950D3YUM8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm4950D3YUM8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm4950D3YUM8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm4950D3YUM8 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm4950D3YUM8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm4950D3YUM8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm4950D3YUM8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm4950D3YUM8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm4950D3YUM8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm4950D3YUM8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm4950D3YUM8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm4950D3YUM8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm4950D3YUM8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm4950D3YUM8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm4950D3YUM8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm4950D3YUM8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm4950D3YUM8 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm4950D3YUM8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm4950D3YUM8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm4950D3YUM8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm4950D3YUM8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm4950D3YUM8 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm4950D3YUM8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm4950D3YUM8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm4950D3YUM8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm4950D3YUM8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm4950D3YUM8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm4950D3YUM8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm4950D3YUM8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm4950D3YUM8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm4950D3YUM8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm4950D3YUM8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms