Protein–RNA interactions for Protein: B2RXC1

Trappc11, Trafficking protein particle complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc11B2RXC1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc11B2RXC1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc11B2RXC1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc11B2RXC1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc11B2RXC1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc11B2RXC1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc11B2RXC1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc11B2RXC1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc11B2RXC1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc11B2RXC1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc11B2RXC1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc11B2RXC1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trappc11B2RXC1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trappc11B2RXC1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trappc11B2RXC1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trappc11B2RXC1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trappc11B2RXC1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Trappc11B2RXC1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trappc11B2RXC1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trappc11B2RXC1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trappc11B2RXC1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trappc11B2RXC1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trappc11B2RXC1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trappc11B2RXC1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc11B2RXC1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc11B2RXC1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc11B2RXC1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc11B2RXC1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc11B2RXC1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc11B2RXC1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc11B2RXC1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc11B2RXC1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc11B2RXC1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc11B2RXC1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc11B2RXC1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trappc11B2RXC1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trappc11B2RXC1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trappc11B2RXC1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trappc11B2RXC1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trappc11B2RXC1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trappc11B2RXC1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trappc11B2RXC1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trappc11B2RXC1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trappc11B2RXC1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trappc11B2RXC1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trappc11B2RXC1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trappc11B2RXC1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trappc11B2RXC1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trappc11B2RXC1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Trappc11B2RXC1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trappc11B2RXC1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trappc11B2RXC1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Trappc11B2RXC1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trappc11B2RXC1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trappc11B2RXC1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trappc11B2RXC1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trappc11B2RXC1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trappc11B2RXC1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trappc11B2RXC1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trappc11B2RXC1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trappc11B2RXC1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trappc11B2RXC1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trappc11B2RXC1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trappc11B2RXC1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trappc11B2RXC1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trappc11B2RXC1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trappc11B2RXC1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trappc11B2RXC1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trappc11B2RXC1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trappc11B2RXC1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trappc11B2RXC1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trappc11B2RXC1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trappc11B2RXC1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trappc11B2RXC1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trappc11B2RXC1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trappc11B2RXC1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trappc11B2RXC1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trappc11B2RXC1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trappc11B2RXC1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trappc11B2RXC1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trappc11B2RXC1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trappc11B2RXC1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trappc11B2RXC1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trappc11B2RXC1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trappc11B2RXC1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trappc11B2RXC1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trappc11B2RXC1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trappc11B2RXC1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trappc11B2RXC1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trappc11B2RXC1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trappc11B2RXC1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trappc11B2RXC1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trappc11B2RXC1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trappc11B2RXC1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trappc11B2RXC1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trappc11B2RXC1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trappc11B2RXC1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trappc11B2RXC1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trappc11B2RXC1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Trappc11B2RXC1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms