Protein–RNA interactions for Protein: B2RX70

Cped1, Cadherin-like and PC-esterase domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cped1B2RX70 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cped1B2RX70 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cped1B2RX70 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cped1B2RX70 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cped1B2RX70 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cped1B2RX70 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cped1B2RX70 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cped1B2RX70 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cped1B2RX70 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cped1B2RX70 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cped1B2RX70 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cped1B2RX70 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cped1B2RX70 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cped1B2RX70 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cped1B2RX70 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cped1B2RX70 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cped1B2RX70 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cped1B2RX70 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cped1B2RX70 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cped1B2RX70 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cped1B2RX70 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cped1B2RX70 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cped1B2RX70 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cped1B2RX70 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cped1B2RX70 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cped1B2RX70 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cped1B2RX70 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cped1B2RX70 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cped1B2RX70 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cped1B2RX70 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cped1B2RX70 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cped1B2RX70 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cped1B2RX70 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cped1B2RX70 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cped1B2RX70 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cped1B2RX70 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cped1B2RX70 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cped1B2RX70 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cped1B2RX70 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cped1B2RX70 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cped1B2RX70 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cped1B2RX70 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cped1B2RX70 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cped1B2RX70 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cped1B2RX70 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cped1B2RX70 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cped1B2RX70 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cped1B2RX70 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cped1B2RX70 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cped1B2RX70 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cped1B2RX70 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cped1B2RX70 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cped1B2RX70 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cped1B2RX70 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cped1B2RX70 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cped1B2RX70 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cped1B2RX70 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cped1B2RX70 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cped1B2RX70 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cped1B2RX70 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cped1B2RX70 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cped1B2RX70 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cped1B2RX70 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cped1B2RX70 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cped1B2RX70 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cped1B2RX70 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cped1B2RX70 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cped1B2RX70 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cped1B2RX70 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cped1B2RX70 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cped1B2RX70 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cped1B2RX70 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cped1B2RX70 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cped1B2RX70 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cped1B2RX70 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cped1B2RX70 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cped1B2RX70 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cped1B2RX70 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cped1B2RX70 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cped1B2RX70 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cped1B2RX70 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cped1B2RX70 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cped1B2RX70 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cped1B2RX70 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cped1B2RX70 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cped1B2RX70 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cped1B2RX70 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cped1B2RX70 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cped1B2RX70 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cped1B2RX70 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cped1B2RX70 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cped1B2RX70 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cped1B2RX70 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cped1B2RX70 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cped1B2RX70 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cped1B2RX70 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cped1B2RX70 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cped1B2RX70 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cped1B2RX70 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cped1B2RX70 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms