Protein–RNA interactions for Protein: B2RVB7

Hbb-bh2, Globin b2, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbb-bh2B2RVB7 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hbb-bh2B2RVB7 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hbb-bh2B2RVB7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hbb-bh2B2RVB7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hbb-bh2B2RVB7 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hbb-bh2B2RVB7 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hbb-bh2B2RVB7 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hbb-bh2B2RVB7 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hbb-bh2B2RVB7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hbb-bh2B2RVB7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hbb-bh2B2RVB7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hbb-bh2B2RVB7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hbb-bh2B2RVB7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hbb-bh2B2RVB7 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hbb-bh2B2RVB7 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hbb-bh2B2RVB7 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hbb-bh2B2RVB7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hbb-bh2B2RVB7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hbb-bh2B2RVB7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hbb-bh2B2RVB7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hbb-bh2B2RVB7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hbb-bh2B2RVB7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hbb-bh2B2RVB7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hbb-bh2B2RVB7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hbb-bh2B2RVB7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hbb-bh2B2RVB7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hbb-bh2B2RVB7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hbb-bh2B2RVB7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hbb-bh2B2RVB7 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hbb-bh2B2RVB7 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hbb-bh2B2RVB7 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hbb-bh2B2RVB7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hbb-bh2B2RVB7 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hbb-bh2B2RVB7 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hbb-bh2B2RVB7 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hbb-bh2B2RVB7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hbb-bh2B2RVB7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hbb-bh2B2RVB7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hbb-bh2B2RVB7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hbb-bh2B2RVB7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hbb-bh2B2RVB7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hbb-bh2B2RVB7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hbb-bh2B2RVB7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hbb-bh2B2RVB7 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hbb-bh2B2RVB7 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hbb-bh2B2RVB7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hbb-bh2B2RVB7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hbb-bh2B2RVB7 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hbb-bh2B2RVB7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hbb-bh2B2RVB7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hbb-bh2B2RVB7 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hbb-bh2B2RVB7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hbb-bh2B2RVB7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hbb-bh2B2RVB7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hbb-bh2B2RVB7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hbb-bh2B2RVB7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hbb-bh2B2RVB7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hbb-bh2B2RVB7 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hbb-bh2B2RVB7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hbb-bh2B2RVB7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hbb-bh2B2RVB7 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hbb-bh2B2RVB7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hbb-bh2B2RVB7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hbb-bh2B2RVB7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hbb-bh2B2RVB7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hbb-bh2B2RVB7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hbb-bh2B2RVB7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hbb-bh2B2RVB7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hbb-bh2B2RVB7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hbb-bh2B2RVB7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hbb-bh2B2RVB7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hbb-bh2B2RVB7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hbb-bh2B2RVB7 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hbb-bh2B2RVB7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hbb-bh2B2RVB7 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hbb-bh2B2RVB7 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hbb-bh2B2RVB7 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hbb-bh2B2RVB7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hbb-bh2B2RVB7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hbb-bh2B2RVB7 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hbb-bh2B2RVB7 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hbb-bh2B2RVB7 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hbb-bh2B2RVB7 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hbb-bh2B2RVB7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hbb-bh2B2RVB7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hbb-bh2B2RVB7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hbb-bh2B2RVB7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hbb-bh2B2RVB7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hbb-bh2B2RVB7 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hbb-bh2B2RVB7 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hbb-bh2B2RVB7 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hbb-bh2B2RVB7 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hbb-bh2B2RVB7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hbb-bh2B2RVB7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hbb-bh2B2RVB7 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hbb-bh2B2RVB7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hbb-bh2B2RVB7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hbb-bh2B2RVB7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hbb-bh2B2RVB7 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hbb-bh2B2RVB7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms