Protein–RNA interactions for Protein: B2RR83

Ythdc2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc2B2RR83 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ythdc2B2RR83 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ythdc2B2RR83 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ythdc2B2RR83 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ythdc2B2RR83 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ythdc2B2RR83 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ythdc2B2RR83 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ythdc2B2RR83 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ythdc2B2RR83 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ythdc2B2RR83 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ythdc2B2RR83 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ythdc2B2RR83 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ythdc2B2RR83 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ythdc2B2RR83 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ythdc2B2RR83 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ythdc2B2RR83 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Ythdc2B2RR83 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Ythdc2B2RR83 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Ythdc2B2RR83 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
Ythdc2B2RR83 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Ythdc2B2RR83 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Ythdc2B2RR83 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Ythdc2B2RR83 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
Ythdc2B2RR83 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ythdc2B2RR83 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ythdc2B2RR83 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ythdc2B2RR83 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ythdc2B2RR83 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ythdc2B2RR83 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ythdc2B2RR83 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ythdc2B2RR83 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ythdc2B2RR83 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ythdc2B2RR83 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ythdc2B2RR83 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ythdc2B2RR83 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ythdc2B2RR83 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ythdc2B2RR83 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ythdc2B2RR83 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Ythdc2B2RR83 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ythdc2B2RR83 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Ythdc2B2RR83 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ythdc2B2RR83 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ythdc2B2RR83 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ythdc2B2RR83 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ythdc2B2RR83 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ythdc2B2RR83 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ythdc2B2RR83 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ythdc2B2RR83 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ythdc2B2RR83 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ythdc2B2RR83 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ythdc2B2RR83 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Ythdc2B2RR83 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ythdc2B2RR83 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ythdc2B2RR83 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ythdc2B2RR83 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ythdc2B2RR83 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Ythdc2B2RR83 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ythdc2B2RR83 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ythdc2B2RR83 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ythdc2B2RR83 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Ythdc2B2RR83 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ythdc2B2RR83 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ythdc2B2RR83 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ythdc2B2RR83 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ythdc2B2RR83 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ythdc2B2RR83 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ythdc2B2RR83 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ythdc2B2RR83 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ythdc2B2RR83 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ythdc2B2RR83 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ythdc2B2RR83 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ythdc2B2RR83 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ythdc2B2RR83 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Ythdc2B2RR83 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ythdc2B2RR83 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ythdc2B2RR83 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ythdc2B2RR83 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ythdc2B2RR83 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ythdc2B2RR83 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ythdc2B2RR83 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Ythdc2B2RR83 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ythdc2B2RR83 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ythdc2B2RR83 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ythdc2B2RR83 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ythdc2B2RR83 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ythdc2B2RR83 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ythdc2B2RR83 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ythdc2B2RR83 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ythdc2B2RR83 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ythdc2B2RR83 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ythdc2B2RR83 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ythdc2B2RR83 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ythdc2B2RR83 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Ythdc2B2RR83 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ythdc2B2RR83 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ythdc2B2RR83 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ythdc2B2RR83 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Ythdc2B2RR83 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ythdc2B2RR83 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ythdc2B2RR83 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms