Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prr29B1ARI9 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prr29B1ARI9 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prr29B1ARI9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prr29B1ARI9 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Prr29B1ARI9 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prr29B1ARI9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prr29B1ARI9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prr29B1ARI9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prr29B1ARI9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prr29B1ARI9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prr29B1ARI9 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Prr29B1ARI9 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prr29B1ARI9 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prr29B1ARI9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prr29B1ARI9 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prr29B1ARI9 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prr29B1ARI9 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prr29B1ARI9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prr29B1ARI9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prr29B1ARI9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Prr29B1ARI9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prr29B1ARI9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prr29B1ARI9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prr29B1ARI9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prr29B1ARI9 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prr29B1ARI9 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prr29B1ARI9 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prr29B1ARI9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prr29B1ARI9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prr29B1ARI9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prr29B1ARI9 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Prr29B1ARI9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prr29B1ARI9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prr29B1ARI9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prr29B1ARI9 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prr29B1ARI9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prr29B1ARI9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prr29B1ARI9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Prr29B1ARI9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Prr29B1ARI9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Prr29B1ARI9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Prr29B1ARI9 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Prr29B1ARI9 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Prr29B1ARI9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prr29B1ARI9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prr29B1ARI9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prr29B1ARI9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prr29B1ARI9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prr29B1ARI9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prr29B1ARI9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Prr29B1ARI9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prr29B1ARI9 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prr29B1ARI9 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prr29B1ARI9 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prr29B1ARI9 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prr29B1ARI9 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prr29B1ARI9 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prr29B1ARI9 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prr29B1ARI9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prr29B1ARI9 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prr29B1ARI9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prr29B1ARI9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prr29B1ARI9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prr29B1ARI9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prr29B1ARI9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prr29B1ARI9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prr29B1ARI9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prr29B1ARI9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Prr29B1ARI9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prr29B1ARI9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prr29B1ARI9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prr29B1ARI9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prr29B1ARI9 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Prr29B1ARI9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prr29B1ARI9 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prr29B1ARI9 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prr29B1ARI9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prr29B1ARI9 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prr29B1ARI9 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Prr29B1ARI9 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prr29B1ARI9 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prr29B1ARI9 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prr29B1ARI9 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prr29B1ARI9 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prr29B1ARI9 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prr29B1ARI9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prr29B1ARI9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prr29B1ARI9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prr29B1ARI9 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prr29B1ARI9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prr29B1ARI9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prr29B1ARI9 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Prr29B1ARI9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prr29B1ARI9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prr29B1ARI9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prr29B1ARI9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prr29B1ARI9 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prr29B1ARI9 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prr29B1ARI9 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms