Protein–RNA interactions for Protein: B1APN4

Rhox1, Reproductive homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox1B1APN4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rhox1B1APN4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rhox1B1APN4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rhox1B1APN4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rhox1B1APN4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rhox1B1APN4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rhox1B1APN4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rhox1B1APN4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rhox1B1APN4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rhox1B1APN4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhox1B1APN4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhox1B1APN4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhox1B1APN4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhox1B1APN4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhox1B1APN4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhox1B1APN4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhox1B1APN4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhox1B1APN4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhox1B1APN4 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhox1B1APN4 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhox1B1APN4 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhox1B1APN4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhox1B1APN4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhox1B1APN4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhox1B1APN4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhox1B1APN4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhox1B1APN4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhox1B1APN4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhox1B1APN4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhox1B1APN4 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhox1B1APN4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhox1B1APN4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhox1B1APN4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhox1B1APN4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhox1B1APN4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhox1B1APN4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhox1B1APN4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhox1B1APN4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhox1B1APN4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhox1B1APN4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhox1B1APN4 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhox1B1APN4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhox1B1APN4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhox1B1APN4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhox1B1APN4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhox1B1APN4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhox1B1APN4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhox1B1APN4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhox1B1APN4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhox1B1APN4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhox1B1APN4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhox1B1APN4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhox1B1APN4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhox1B1APN4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhox1B1APN4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhox1B1APN4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhox1B1APN4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhox1B1APN4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhox1B1APN4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhox1B1APN4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhox1B1APN4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhox1B1APN4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhox1B1APN4 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhox1B1APN4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhox1B1APN4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhox1B1APN4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhox1B1APN4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhox1B1APN4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhox1B1APN4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhox1B1APN4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhox1B1APN4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhox1B1APN4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhox1B1APN4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhox1B1APN4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhox1B1APN4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhox1B1APN4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhox1B1APN4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhox1B1APN4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhox1B1APN4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhox1B1APN4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhox1B1APN4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhox1B1APN4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rhox1B1APN4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhox1B1APN4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhox1B1APN4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhox1B1APN4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhox1B1APN4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhox1B1APN4 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhox1B1APN4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhox1B1APN4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhox1B1APN4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhox1B1APN4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhox1B1APN4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhox1B1APN4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhox1B1APN4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhox1B1APN4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhox1B1APN4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhox1B1APN4 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhox1B1APN4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhox1B1APN4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms