Protein–RNA interactions for Protein: A6H6T1

Prss40, Serine protease 40, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss40A6H6T1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prss40A6H6T1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prss40A6H6T1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prss40A6H6T1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prss40A6H6T1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prss40A6H6T1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prss40A6H6T1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prss40A6H6T1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prss40A6H6T1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prss40A6H6T1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prss40A6H6T1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prss40A6H6T1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prss40A6H6T1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Prss40A6H6T1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prss40A6H6T1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prss40A6H6T1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prss40A6H6T1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prss40A6H6T1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prss40A6H6T1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prss40A6H6T1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prss40A6H6T1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prss40A6H6T1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prss40A6H6T1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prss40A6H6T1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prss40A6H6T1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Prss40A6H6T1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prss40A6H6T1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prss40A6H6T1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prss40A6H6T1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prss40A6H6T1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prss40A6H6T1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prss40A6H6T1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prss40A6H6T1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prss40A6H6T1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prss40A6H6T1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prss40A6H6T1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prss40A6H6T1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prss40A6H6T1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prss40A6H6T1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prss40A6H6T1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prss40A6H6T1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prss40A6H6T1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prss40A6H6T1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Prss40A6H6T1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prss40A6H6T1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prss40A6H6T1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prss40A6H6T1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Prss40A6H6T1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prss40A6H6T1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prss40A6H6T1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prss40A6H6T1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Prss40A6H6T1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prss40A6H6T1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prss40A6H6T1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prss40A6H6T1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prss40A6H6T1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prss40A6H6T1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prss40A6H6T1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prss40A6H6T1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prss40A6H6T1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prss40A6H6T1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prss40A6H6T1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prss40A6H6T1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Prss40A6H6T1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prss40A6H6T1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prss40A6H6T1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prss40A6H6T1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prss40A6H6T1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prss40A6H6T1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prss40A6H6T1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prss40A6H6T1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Prss40A6H6T1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prss40A6H6T1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prss40A6H6T1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prss40A6H6T1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prss40A6H6T1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prss40A6H6T1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prss40A6H6T1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prss40A6H6T1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prss40A6H6T1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prss40A6H6T1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prss40A6H6T1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prss40A6H6T1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prss40A6H6T1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prss40A6H6T1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prss40A6H6T1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prss40A6H6T1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Prss40A6H6T1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prss40A6H6T1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prss40A6H6T1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prss40A6H6T1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prss40A6H6T1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Prss40A6H6T1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prss40A6H6T1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prss40A6H6T1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prss40A6H6T1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Prss40A6H6T1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prss40A6H6T1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prss40A6H6T1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Prss40A6H6T1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms