Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ77

Prdm12, PR domain zinc finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm12A2AJ77 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prdm12A2AJ77 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prdm12A2AJ77 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prdm12A2AJ77 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prdm12A2AJ77 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prdm12A2AJ77 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prdm12A2AJ77 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prdm12A2AJ77 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prdm12A2AJ77 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prdm12A2AJ77 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prdm12A2AJ77 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prdm12A2AJ77 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prdm12A2AJ77 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prdm12A2AJ77 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prdm12A2AJ77 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prdm12A2AJ77 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prdm12A2AJ77 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prdm12A2AJ77 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prdm12A2AJ77 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prdm12A2AJ77 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prdm12A2AJ77 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prdm12A2AJ77 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prdm12A2AJ77 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prdm12A2AJ77 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prdm12A2AJ77 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prdm12A2AJ77 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prdm12A2AJ77 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prdm12A2AJ77 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prdm12A2AJ77 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prdm12A2AJ77 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prdm12A2AJ77 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prdm12A2AJ77 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prdm12A2AJ77 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prdm12A2AJ77 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Prdm12A2AJ77 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prdm12A2AJ77 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prdm12A2AJ77 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prdm12A2AJ77 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prdm12A2AJ77 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prdm12A2AJ77 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prdm12A2AJ77 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prdm12A2AJ77 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prdm12A2AJ77 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prdm12A2AJ77 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prdm12A2AJ77 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prdm12A2AJ77 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prdm12A2AJ77 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prdm12A2AJ77 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prdm12A2AJ77 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prdm12A2AJ77 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prdm12A2AJ77 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prdm12A2AJ77 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prdm12A2AJ77 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prdm12A2AJ77 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prdm12A2AJ77 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prdm12A2AJ77 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prdm12A2AJ77 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prdm12A2AJ77 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prdm12A2AJ77 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prdm12A2AJ77 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prdm12A2AJ77 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Prdm12A2AJ77 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prdm12A2AJ77 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prdm12A2AJ77 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prdm12A2AJ77 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prdm12A2AJ77 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prdm12A2AJ77 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prdm12A2AJ77 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prdm12A2AJ77 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prdm12A2AJ77 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prdm12A2AJ77 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prdm12A2AJ77 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prdm12A2AJ77 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prdm12A2AJ77 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prdm12A2AJ77 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prdm12A2AJ77 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prdm12A2AJ77 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prdm12A2AJ77 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prdm12A2AJ77 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prdm12A2AJ77 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prdm12A2AJ77 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prdm12A2AJ77 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prdm12A2AJ77 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prdm12A2AJ77 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prdm12A2AJ77 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prdm12A2AJ77 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prdm12A2AJ77 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prdm12A2AJ77 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prdm12A2AJ77 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prdm12A2AJ77 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prdm12A2AJ77 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prdm12A2AJ77 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prdm12A2AJ77 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prdm12A2AJ77 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prdm12A2AJ77 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prdm12A2AJ77 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prdm12A2AJ77 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prdm12A2AJ77 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prdm12A2AJ77 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prdm12A2AJ77 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms