Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ambra1A2AH22 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ambra1A2AH22 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ambra1A2AH22 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ambra1A2AH22 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ambra1A2AH22 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ambra1A2AH22 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ambra1A2AH22 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ambra1A2AH22 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ambra1A2AH22 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ambra1A2AH22 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ambra1A2AH22 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ambra1A2AH22 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ambra1A2AH22 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ambra1A2AH22 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ambra1A2AH22 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ambra1A2AH22 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ambra1A2AH22 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ambra1A2AH22 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ambra1A2AH22 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ambra1A2AH22 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ambra1A2AH22 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ambra1A2AH22 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ambra1A2AH22 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ambra1A2AH22 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ambra1A2AH22 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ambra1A2AH22 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ambra1A2AH22 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ambra1A2AH22 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ambra1A2AH22 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ambra1A2AH22 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ambra1A2AH22 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ambra1A2AH22 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ambra1A2AH22 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ambra1A2AH22 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ambra1A2AH22 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ambra1A2AH22 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ambra1A2AH22 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ambra1A2AH22 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ambra1A2AH22 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ambra1A2AH22 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ambra1A2AH22 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ambra1A2AH22 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ambra1A2AH22 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ambra1A2AH22 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ambra1A2AH22 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ambra1A2AH22 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ambra1A2AH22 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ambra1A2AH22 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ambra1A2AH22 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ambra1A2AH22 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ambra1A2AH22 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ambra1A2AH22 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ambra1A2AH22 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ambra1A2AH22 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ambra1A2AH22 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ambra1A2AH22 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ambra1A2AH22 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ambra1A2AH22 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ambra1A2AH22 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ambra1A2AH22 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ambra1A2AH22 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ambra1A2AH22 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ambra1A2AH22 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ambra1A2AH22 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ambra1A2AH22 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ambra1A2AH22 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ambra1A2AH22 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ambra1A2AH22 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ambra1A2AH22 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ambra1A2AH22 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ambra1A2AH22 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ambra1A2AH22 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ambra1A2AH22 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ambra1A2AH22 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ambra1A2AH22 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ambra1A2AH22 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ambra1A2AH22 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ambra1A2AH22 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ambra1A2AH22 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ambra1A2AH22 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ambra1A2AH22 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ambra1A2AH22 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ambra1A2AH22 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ambra1A2AH22 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ambra1A2AH22 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ambra1A2AH22 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ambra1A2AH22 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ambra1A2AH22 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ambra1A2AH22 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ambra1A2AH22 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ambra1A2AH22 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ambra1A2AH22 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ambra1A2AH22 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ambra1A2AH22 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ambra1A2AH22 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ambra1A2AH22 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ambra1A2AH22 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ambra1A2AH22 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ambra1A2AH22 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms