Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR2

4930447F04Rik, RIKEN cDNA 4930447F04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930447F04RikA2AFR2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
4930447F04RikA2AFR2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
4930447F04RikA2AFR2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
4930447F04RikA2AFR2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
4930447F04RikA2AFR2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
4930447F04RikA2AFR2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
4930447F04RikA2AFR2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
4930447F04RikA2AFR2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
4930447F04RikA2AFR2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
4930447F04RikA2AFR2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
4930447F04RikA2AFR2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
4930447F04RikA2AFR2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
4930447F04RikA2AFR2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
4930447F04RikA2AFR2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
4930447F04RikA2AFR2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
4930447F04RikA2AFR2 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
4930447F04RikA2AFR2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
4930447F04RikA2AFR2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
4930447F04RikA2AFR2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
4930447F04RikA2AFR2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
4930447F04RikA2AFR2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
4930447F04RikA2AFR2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
4930447F04RikA2AFR2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
4930447F04RikA2AFR2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
4930447F04RikA2AFR2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
4930447F04RikA2AFR2 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
4930447F04RikA2AFR2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
4930447F04RikA2AFR2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
4930447F04RikA2AFR2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
4930447F04RikA2AFR2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms