Protein–RNA interactions for Protein: A0JLY1

Ccdc173, Coiled-coil domain-containing protein 173, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc173A0JLY1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc173A0JLY1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc173A0JLY1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc173A0JLY1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc173A0JLY1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc173A0JLY1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc173A0JLY1 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc173A0JLY1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc173A0JLY1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc173A0JLY1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc173A0JLY1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc173A0JLY1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc173A0JLY1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc173A0JLY1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc173A0JLY1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc173A0JLY1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc173A0JLY1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc173A0JLY1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc173A0JLY1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc173A0JLY1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc173A0JLY1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc173A0JLY1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc173A0JLY1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc173A0JLY1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc173A0JLY1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc173A0JLY1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc173A0JLY1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc173A0JLY1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc173A0JLY1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc173A0JLY1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc173A0JLY1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc173A0JLY1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc173A0JLY1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc173A0JLY1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc173A0JLY1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc173A0JLY1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc173A0JLY1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc173A0JLY1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc173A0JLY1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc173A0JLY1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc173A0JLY1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc173A0JLY1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc173A0JLY1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc173A0JLY1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc173A0JLY1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc173A0JLY1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc173A0JLY1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc173A0JLY1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc173A0JLY1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc173A0JLY1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc173A0JLY1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc173A0JLY1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc173A0JLY1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc173A0JLY1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc173A0JLY1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc173A0JLY1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc173A0JLY1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc173A0JLY1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc173A0JLY1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc173A0JLY1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc173A0JLY1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc173A0JLY1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc173A0JLY1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc173A0JLY1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc173A0JLY1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc173A0JLY1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc173A0JLY1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc173A0JLY1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc173A0JLY1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc173A0JLY1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc173A0JLY1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc173A0JLY1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc173A0JLY1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc173A0JLY1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc173A0JLY1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc173A0JLY1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc173A0JLY1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc173A0JLY1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc173A0JLY1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc173A0JLY1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc173A0JLY1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc173A0JLY1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc173A0JLY1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc173A0JLY1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc173A0JLY1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc173A0JLY1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc173A0JLY1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc173A0JLY1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc173A0JLY1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc173A0JLY1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc173A0JLY1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc173A0JLY1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc173A0JLY1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc173A0JLY1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc173A0JLY1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc173A0JLY1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc173A0JLY1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc173A0JLY1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc173A0JLY1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc173A0JLY1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms