Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5U3

Ighv1-62-1, Immunoglobulin heavy variable 1-62-1 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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Ighv1-62-1A0A075B5U3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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Ighv1-62-1A0A075B5U3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ighv1-62-1A0A075B5U3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ighv1-62-1A0A075B5U3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
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Ighv1-62-1A0A075B5U3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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Ighv1-62-1A0A075B5U3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
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Ighv1-62-1A0A075B5U3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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Ighv1-62-1A0A075B5U3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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Ighv1-62-1A0A075B5U3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Ighv1-62-1A0A075B5U3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Ighv1-62-1A0A075B5U3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Ighv1-62-1A0A075B5U3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ighv1-62-1A0A075B5U3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Ighv1-62-1A0A075B5U3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv1-62-1A0A075B5U3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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