Protein–RNA interactions for Protein: S4R181

Ccdc166, Coiled-coil domain-containing 166, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc166S4R181 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc166S4R181 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc166S4R181 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc166S4R181 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc166S4R181 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc166S4R181 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc166S4R181 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc166S4R181 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc166S4R181 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc166S4R181 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc166S4R181 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc166S4R181 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc166S4R181 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc166S4R181 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc166S4R181 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc166S4R181 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc166S4R181 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc166S4R181 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc166S4R181 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc166S4R181 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc166S4R181 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc166S4R181 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc166S4R181 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc166S4R181 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc166S4R181 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc166S4R181 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc166S4R181 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc166S4R181 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc166S4R181 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc166S4R181 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc166S4R181 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc166S4R181 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc166S4R181 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc166S4R181 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc166S4R181 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc166S4R181 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc166S4R181 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc166S4R181 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc166S4R181 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc166S4R181 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc166S4R181 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc166S4R181 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc166S4R181 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc166S4R181 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc166S4R181 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc166S4R181 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc166S4R181 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc166S4R181 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc166S4R181 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc166S4R181 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc166S4R181 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc166S4R181 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc166S4R181 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc166S4R181 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc166S4R181 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc166S4R181 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc166S4R181 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc166S4R181 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc166S4R181 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc166S4R181 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc166S4R181 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc166S4R181 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc166S4R181 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc166S4R181 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc166S4R181 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc166S4R181 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc166S4R181 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc166S4R181 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc166S4R181 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc166S4R181 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc166S4R181 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc166S4R181 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc166S4R181 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc166S4R181 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc166S4R181 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc166S4R181 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc166S4R181 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc166S4R181 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc166S4R181 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc166S4R181 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc166S4R181 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc166S4R181 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc166S4R181 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc166S4R181 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc166S4R181 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc166S4R181 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc166S4R181 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc166S4R181 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc166S4R181 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc166S4R181 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc166S4R181 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc166S4R181 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc166S4R181 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc166S4R181 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc166S4R181 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc166S4R181 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc166S4R181 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc166S4R181 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc166S4R181 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc166S4R181 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms