Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

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Length 448 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt27Q9Z320 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt27Q9Z320 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt27Q9Z320 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt27Q9Z320 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt27Q9Z320 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt27Q9Z320 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt27Q9Z320 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt27Q9Z320 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt27Q9Z320 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt27Q9Z320 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt27Q9Z320 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt27Q9Z320 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt27Q9Z320 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt27Q9Z320 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt27Q9Z320 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt27Q9Z320 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt27Q9Z320 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Krt27Q9Z320 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Krt27Q9Z320 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Krt27Q9Z320 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Krt27Q9Z320 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Krt27Q9Z320 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Krt27Q9Z320 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Krt27Q9Z320 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Krt27Q9Z320 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Krt27Q9Z320 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Krt27Q9Z320 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Krt27Q9Z320 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Krt27Q9Z320 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Krt27Q9Z320 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt27Q9Z320 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt27Q9Z320 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt27Q9Z320 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt27Q9Z320 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt27Q9Z320 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt27Q9Z320 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt27Q9Z320 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt27Q9Z320 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt27Q9Z320 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt27Q9Z320 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt27Q9Z320 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt27Q9Z320 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt27Q9Z320 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt27Q9Z320 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt27Q9Z320 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt27Q9Z320 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt27Q9Z320 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt27Q9Z320 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt27Q9Z320 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt27Q9Z320 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt27Q9Z320 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt27Q9Z320 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt27Q9Z320 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt27Q9Z320 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt27Q9Z320 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt27Q9Z320 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt27Q9Z320 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt27Q9Z320 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt27Q9Z320 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt27Q9Z320 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt27Q9Z320 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt27Q9Z320 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt27Q9Z320 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt27Q9Z320 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt27Q9Z320 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt27Q9Z320 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt27Q9Z320 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt27Q9Z320 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt27Q9Z320 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt27Q9Z320 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt27Q9Z320 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt27Q9Z320 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt27Q9Z320 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt27Q9Z320 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt27Q9Z320 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt27Q9Z320 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt27Q9Z320 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt27Q9Z320 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt27Q9Z320 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt27Q9Z320 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt27Q9Z320 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt27Q9Z320 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt27Q9Z320 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt27Q9Z320 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt27Q9Z320 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt27Q9Z320 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt27Q9Z320 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt27Q9Z320 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt27Q9Z320 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt27Q9Z320 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt27Q9Z320 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt27Q9Z320 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt27Q9Z320 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt27Q9Z320 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt27Q9Z320 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt27Q9Z320 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt27Q9Z320 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt27Q9Z320 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt27Q9Z320 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
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