Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E1

Mbd2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd2Q9Z2E1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mbd2Q9Z2E1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mbd2Q9Z2E1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mbd2Q9Z2E1 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mbd2Q9Z2E1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mbd2Q9Z2E1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd2Q9Z2E1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd2Q9Z2E1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd2Q9Z2E1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd2Q9Z2E1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd2Q9Z2E1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd2Q9Z2E1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd2Q9Z2E1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd2Q9Z2E1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd2Q9Z2E1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd2Q9Z2E1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd2Q9Z2E1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd2Q9Z2E1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd2Q9Z2E1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd2Q9Z2E1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd2Q9Z2E1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd2Q9Z2E1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd2Q9Z2E1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd2Q9Z2E1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd2Q9Z2E1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd2Q9Z2E1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd2Q9Z2E1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd2Q9Z2E1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd2Q9Z2E1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd2Q9Z2E1 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd2Q9Z2E1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd2Q9Z2E1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd2Q9Z2E1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd2Q9Z2E1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd2Q9Z2E1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd2Q9Z2E1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd2Q9Z2E1 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mbd2Q9Z2E1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mbd2Q9Z2E1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mbd2Q9Z2E1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mbd2Q9Z2E1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mbd2Q9Z2E1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mbd2Q9Z2E1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mbd2Q9Z2E1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mbd2Q9Z2E1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mbd2Q9Z2E1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mbd2Q9Z2E1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mbd2Q9Z2E1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Mbd2Q9Z2E1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mbd2Q9Z2E1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mbd2Q9Z2E1 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mbd2Q9Z2E1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mbd2Q9Z2E1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mbd2Q9Z2E1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mbd2Q9Z2E1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mbd2Q9Z2E1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mbd2Q9Z2E1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mbd2Q9Z2E1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mbd2Q9Z2E1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mbd2Q9Z2E1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mbd2Q9Z2E1 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mbd2Q9Z2E1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mbd2Q9Z2E1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mbd2Q9Z2E1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mbd2Q9Z2E1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mbd2Q9Z2E1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mbd2Q9Z2E1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mbd2Q9Z2E1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mbd2Q9Z2E1 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mbd2Q9Z2E1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Mbd2Q9Z2E1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mbd2Q9Z2E1 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mbd2Q9Z2E1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mbd2Q9Z2E1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mbd2Q9Z2E1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mbd2Q9Z2E1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Mbd2Q9Z2E1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mbd2Q9Z2E1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mbd2Q9Z2E1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mbd2Q9Z2E1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mbd2Q9Z2E1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mbd2Q9Z2E1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mbd2Q9Z2E1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mbd2Q9Z2E1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mbd2Q9Z2E1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mbd2Q9Z2E1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mbd2Q9Z2E1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mbd2Q9Z2E1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mbd2Q9Z2E1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mbd2Q9Z2E1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mbd2Q9Z2E1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mbd2Q9Z2E1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mbd2Q9Z2E1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mbd2Q9Z2E1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mbd2Q9Z2E1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mbd2Q9Z2E1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Mbd2Q9Z2E1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Mbd2Q9Z2E1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Mbd2Q9Z2E1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mbd2Q9Z2E1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms