Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mbd3Q9Z2D8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mbd3Q9Z2D8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mbd3Q9Z2D8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Mbd3Q9Z2D8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mbd3Q9Z2D8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mbd3Q9Z2D8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mbd3Q9Z2D8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mbd3Q9Z2D8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mbd3Q9Z2D8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Mbd3Q9Z2D8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mbd3Q9Z2D8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Mbd3Q9Z2D8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mbd3Q9Z2D8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mbd3Q9Z2D8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mbd3Q9Z2D8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mbd3Q9Z2D8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mbd3Q9Z2D8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mbd3Q9Z2D8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mbd3Q9Z2D8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mbd3Q9Z2D8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mbd3Q9Z2D8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Mbd3Q9Z2D8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mbd3Q9Z2D8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mbd3Q9Z2D8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mbd3Q9Z2D8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mbd3Q9Z2D8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mbd3Q9Z2D8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mbd3Q9Z2D8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mbd3Q9Z2D8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mbd3Q9Z2D8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Mbd3Q9Z2D8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mbd3Q9Z2D8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mbd3Q9Z2D8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mbd3Q9Z2D8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mbd3Q9Z2D8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Mbd3Q9Z2D8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mbd3Q9Z2D8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mbd3Q9Z2D8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mbd3Q9Z2D8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mbd3Q9Z2D8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mbd3Q9Z2D8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mbd3Q9Z2D8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mbd3Q9Z2D8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mbd3Q9Z2D8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mbd3Q9Z2D8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mbd3Q9Z2D8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mbd3Q9Z2D8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mbd3Q9Z2D8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mbd3Q9Z2D8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mbd3Q9Z2D8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mbd3Q9Z2D8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mbd3Q9Z2D8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mbd3Q9Z2D8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mbd3Q9Z2D8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mbd3Q9Z2D8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mbd3Q9Z2D8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mbd3Q9Z2D8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Mbd3Q9Z2D8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Mbd3Q9Z2D8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Mbd3Q9Z2D8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Mbd3Q9Z2D8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Mbd3Q9Z2D8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mbd3Q9Z2D8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mbd3Q9Z2D8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mbd3Q9Z2D8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mbd3Q9Z2D8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mbd3Q9Z2D8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mbd3Q9Z2D8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mbd3Q9Z2D8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mbd3Q9Z2D8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mbd3Q9Z2D8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mbd3Q9Z2D8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mbd3Q9Z2D8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mbd3Q9Z2D8 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mbd3Q9Z2D8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mbd3Q9Z2D8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mbd3Q9Z2D8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mbd3Q9Z2D8 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mbd3Q9Z2D8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mbd3Q9Z2D8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mbd3Q9Z2D8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mbd3Q9Z2D8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mbd3Q9Z2D8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mbd3Q9Z2D8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Mbd3Q9Z2D8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mbd3Q9Z2D8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mbd3Q9Z2D8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mbd3Q9Z2D8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mbd3Q9Z2D8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mbd3Q9Z2D8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mbd3Q9Z2D8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mbd3Q9Z2D8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mbd3Q9Z2D8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mbd3Q9Z2D8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mbd3Q9Z2D8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mbd3Q9Z2D8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Mbd3Q9Z2D8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Mbd3Q9Z2D8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Mbd3Q9Z2D8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms