Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z273

Tulp1, Tubby-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp1Q9Z273 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tulp1Q9Z273 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tulp1Q9Z273 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tulp1Q9Z273 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Tulp1Q9Z273 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tulp1Q9Z273 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tulp1Q9Z273 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tulp1Q9Z273 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tulp1Q9Z273 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tulp1Q9Z273 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tulp1Q9Z273 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tulp1Q9Z273 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tulp1Q9Z273 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tulp1Q9Z273 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tulp1Q9Z273 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tulp1Q9Z273 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tulp1Q9Z273 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tulp1Q9Z273 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tulp1Q9Z273 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tulp1Q9Z273 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tulp1Q9Z273 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tulp1Q9Z273 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tulp1Q9Z273 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Tulp1Q9Z273 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tulp1Q9Z273 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tulp1Q9Z273 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tulp1Q9Z273 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tulp1Q9Z273 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tulp1Q9Z273 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tulp1Q9Z273 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tulp1Q9Z273 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tulp1Q9Z273 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tulp1Q9Z273 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tulp1Q9Z273 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tulp1Q9Z273 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tulp1Q9Z273 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tulp1Q9Z273 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tulp1Q9Z273 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tulp1Q9Z273 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tulp1Q9Z273 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tulp1Q9Z273 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tulp1Q9Z273 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tulp1Q9Z273 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tulp1Q9Z273 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tulp1Q9Z273 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tulp1Q9Z273 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tulp1Q9Z273 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tulp1Q9Z273 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tulp1Q9Z273 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tulp1Q9Z273 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tulp1Q9Z273 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tulp1Q9Z273 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tulp1Q9Z273 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Tulp1Q9Z273 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tulp1Q9Z273 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tulp1Q9Z273 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tulp1Q9Z273 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tulp1Q9Z273 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tulp1Q9Z273 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tulp1Q9Z273 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tulp1Q9Z273 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tulp1Q9Z273 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tulp1Q9Z273 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tulp1Q9Z273 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tulp1Q9Z273 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tulp1Q9Z273 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tulp1Q9Z273 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Tulp1Q9Z273 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tulp1Q9Z273 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tulp1Q9Z273 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tulp1Q9Z273 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tulp1Q9Z273 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tulp1Q9Z273 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tulp1Q9Z273 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Tulp1Q9Z273 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tulp1Q9Z273 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tulp1Q9Z273 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Tulp1Q9Z273 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tulp1Q9Z273 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tulp1Q9Z273 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tulp1Q9Z273 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Tulp1Q9Z273 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tulp1Q9Z273 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tulp1Q9Z273 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tulp1Q9Z273 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tulp1Q9Z273 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Tulp1Q9Z273 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tulp1Q9Z273 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tulp1Q9Z273 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tulp1Q9Z273 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tulp1Q9Z273 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tulp1Q9Z273 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tulp1Q9Z273 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tulp1Q9Z273 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tulp1Q9Z273 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tulp1Q9Z273 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tulp1Q9Z273 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tulp1Q9Z273 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tulp1Q9Z273 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Tulp1Q9Z273 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms