Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z238

Ccne2, G1/S-specific cyclin-E2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne2Q9Z238 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccne2Q9Z238 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccne2Q9Z238 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccne2Q9Z238 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccne2Q9Z238 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccne2Q9Z238 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccne2Q9Z238 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccne2Q9Z238 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccne2Q9Z238 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccne2Q9Z238 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccne2Q9Z238 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccne2Q9Z238 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccne2Q9Z238 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccne2Q9Z238 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccne2Q9Z238 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccne2Q9Z238 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccne2Q9Z238 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccne2Q9Z238 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccne2Q9Z238 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccne2Q9Z238 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccne2Q9Z238 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccne2Q9Z238 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccne2Q9Z238 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccne2Q9Z238 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccne2Q9Z238 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccne2Q9Z238 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccne2Q9Z238 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccne2Q9Z238 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccne2Q9Z238 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccne2Q9Z238 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccne2Q9Z238 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccne2Q9Z238 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccne2Q9Z238 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccne2Q9Z238 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccne2Q9Z238 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccne2Q9Z238 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccne2Q9Z238 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccne2Q9Z238 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccne2Q9Z238 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccne2Q9Z238 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccne2Q9Z238 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccne2Q9Z238 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccne2Q9Z238 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccne2Q9Z238 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccne2Q9Z238 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccne2Q9Z238 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccne2Q9Z238 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccne2Q9Z238 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccne2Q9Z238 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccne2Q9Z238 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccne2Q9Z238 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccne2Q9Z238 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccne2Q9Z238 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccne2Q9Z238 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccne2Q9Z238 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccne2Q9Z238 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccne2Q9Z238 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccne2Q9Z238 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccne2Q9Z238 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccne2Q9Z238 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccne2Q9Z238 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccne2Q9Z238 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccne2Q9Z238 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccne2Q9Z238 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccne2Q9Z238 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccne2Q9Z238 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccne2Q9Z238 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccne2Q9Z238 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccne2Q9Z238 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccne2Q9Z238 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccne2Q9Z238 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccne2Q9Z238 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccne2Q9Z238 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccne2Q9Z238 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccne2Q9Z238 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccne2Q9Z238 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccne2Q9Z238 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccne2Q9Z238 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccne2Q9Z238 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccne2Q9Z238 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccne2Q9Z238 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccne2Q9Z238 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccne2Q9Z238 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccne2Q9Z238 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccne2Q9Z238 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccne2Q9Z238 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccne2Q9Z238 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccne2Q9Z238 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccne2Q9Z238 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccne2Q9Z238 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccne2Q9Z238 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccne2Q9Z238 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccne2Q9Z238 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccne2Q9Z238 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccne2Q9Z238 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccne2Q9Z238 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccne2Q9Z238 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccne2Q9Z238 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccne2Q9Z238 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccne2Q9Z238 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms