Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W1

Ngfr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgfrQ9Z0W1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NgfrQ9Z0W1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NgfrQ9Z0W1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NgfrQ9Z0W1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NgfrQ9Z0W1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NgfrQ9Z0W1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NgfrQ9Z0W1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NgfrQ9Z0W1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NgfrQ9Z0W1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NgfrQ9Z0W1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NgfrQ9Z0W1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NgfrQ9Z0W1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NgfrQ9Z0W1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NgfrQ9Z0W1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NgfrQ9Z0W1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NgfrQ9Z0W1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NgfrQ9Z0W1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NgfrQ9Z0W1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NgfrQ9Z0W1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NgfrQ9Z0W1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NgfrQ9Z0W1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NgfrQ9Z0W1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NgfrQ9Z0W1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NgfrQ9Z0W1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NgfrQ9Z0W1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NgfrQ9Z0W1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NgfrQ9Z0W1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NgfrQ9Z0W1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NgfrQ9Z0W1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NgfrQ9Z0W1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NgfrQ9Z0W1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NgfrQ9Z0W1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NgfrQ9Z0W1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NgfrQ9Z0W1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NgfrQ9Z0W1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NgfrQ9Z0W1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NgfrQ9Z0W1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NgfrQ9Z0W1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NgfrQ9Z0W1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NgfrQ9Z0W1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NgfrQ9Z0W1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NgfrQ9Z0W1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NgfrQ9Z0W1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NgfrQ9Z0W1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NgfrQ9Z0W1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NgfrQ9Z0W1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NgfrQ9Z0W1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NgfrQ9Z0W1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NgfrQ9Z0W1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NgfrQ9Z0W1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NgfrQ9Z0W1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NgfrQ9Z0W1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NgfrQ9Z0W1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NgfrQ9Z0W1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NgfrQ9Z0W1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NgfrQ9Z0W1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NgfrQ9Z0W1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NgfrQ9Z0W1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NgfrQ9Z0W1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NgfrQ9Z0W1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NgfrQ9Z0W1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NgfrQ9Z0W1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NgfrQ9Z0W1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NgfrQ9Z0W1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NgfrQ9Z0W1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NgfrQ9Z0W1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NgfrQ9Z0W1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NgfrQ9Z0W1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NgfrQ9Z0W1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NgfrQ9Z0W1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NgfrQ9Z0W1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NgfrQ9Z0W1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NgfrQ9Z0W1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NgfrQ9Z0W1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NgfrQ9Z0W1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NgfrQ9Z0W1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NgfrQ9Z0W1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NgfrQ9Z0W1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NgfrQ9Z0W1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NgfrQ9Z0W1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NgfrQ9Z0W1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NgfrQ9Z0W1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NgfrQ9Z0W1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NgfrQ9Z0W1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NgfrQ9Z0W1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NgfrQ9Z0W1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NgfrQ9Z0W1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NgfrQ9Z0W1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NgfrQ9Z0W1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NgfrQ9Z0W1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NgfrQ9Z0W1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NgfrQ9Z0W1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NgfrQ9Z0W1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NgfrQ9Z0W1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NgfrQ9Z0W1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NgfrQ9Z0W1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NgfrQ9Z0W1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NgfrQ9Z0W1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NgfrQ9Z0W1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NgfrQ9Z0W1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms