Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUP4

Srd5a3, Polyprenol reductase, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srd5a3Q9WUP4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Srd5a3Q9WUP4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Srd5a3Q9WUP4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Srd5a3Q9WUP4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Srd5a3Q9WUP4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Srd5a3Q9WUP4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Srd5a3Q9WUP4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Srd5a3Q9WUP4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Srd5a3Q9WUP4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Srd5a3Q9WUP4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Srd5a3Q9WUP4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Srd5a3Q9WUP4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Srd5a3Q9WUP4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Srd5a3Q9WUP4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Srd5a3Q9WUP4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Srd5a3Q9WUP4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Srd5a3Q9WUP4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Srd5a3Q9WUP4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Srd5a3Q9WUP4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Srd5a3Q9WUP4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Srd5a3Q9WUP4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Srd5a3Q9WUP4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Srd5a3Q9WUP4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Srd5a3Q9WUP4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Srd5a3Q9WUP4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Srd5a3Q9WUP4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Srd5a3Q9WUP4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Srd5a3Q9WUP4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Srd5a3Q9WUP4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Srd5a3Q9WUP4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Srd5a3Q9WUP4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Srd5a3Q9WUP4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Srd5a3Q9WUP4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Srd5a3Q9WUP4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Srd5a3Q9WUP4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Srd5a3Q9WUP4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Srd5a3Q9WUP4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Srd5a3Q9WUP4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Srd5a3Q9WUP4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Srd5a3Q9WUP4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Srd5a3Q9WUP4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Srd5a3Q9WUP4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Srd5a3Q9WUP4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Srd5a3Q9WUP4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Srd5a3Q9WUP4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Srd5a3Q9WUP4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Srd5a3Q9WUP4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Srd5a3Q9WUP4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Srd5a3Q9WUP4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Srd5a3Q9WUP4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Srd5a3Q9WUP4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Srd5a3Q9WUP4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Srd5a3Q9WUP4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Srd5a3Q9WUP4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Srd5a3Q9WUP4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Srd5a3Q9WUP4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Srd5a3Q9WUP4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Srd5a3Q9WUP4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Srd5a3Q9WUP4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Srd5a3Q9WUP4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Srd5a3Q9WUP4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Srd5a3Q9WUP4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Srd5a3Q9WUP4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Srd5a3Q9WUP4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Srd5a3Q9WUP4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Srd5a3Q9WUP4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Srd5a3Q9WUP4 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Srd5a3Q9WUP4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Srd5a3Q9WUP4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Srd5a3Q9WUP4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Srd5a3Q9WUP4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Srd5a3Q9WUP4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Srd5a3Q9WUP4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Srd5a3Q9WUP4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Srd5a3Q9WUP4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Srd5a3Q9WUP4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Srd5a3Q9WUP4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Srd5a3Q9WUP4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Srd5a3Q9WUP4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Srd5a3Q9WUP4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Srd5a3Q9WUP4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Srd5a3Q9WUP4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Srd5a3Q9WUP4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Srd5a3Q9WUP4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Srd5a3Q9WUP4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Srd5a3Q9WUP4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Srd5a3Q9WUP4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Srd5a3Q9WUP4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Srd5a3Q9WUP4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Srd5a3Q9WUP4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Srd5a3Q9WUP4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Srd5a3Q9WUP4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Srd5a3Q9WUP4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Srd5a3Q9WUP4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Srd5a3Q9WUP4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Srd5a3Q9WUP4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Srd5a3Q9WUP4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Srd5a3Q9WUP4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Srd5a3Q9WUP4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Srd5a3Q9WUP4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms