Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUK7

Opn3, Opsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn3Q9WUK7 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Opn3Q9WUK7 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Opn3Q9WUK7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Opn3Q9WUK7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Opn3Q9WUK7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Opn3Q9WUK7 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Opn3Q9WUK7 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Opn3Q9WUK7 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Opn3Q9WUK7 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Opn3Q9WUK7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Opn3Q9WUK7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Opn3Q9WUK7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Opn3Q9WUK7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Opn3Q9WUK7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Opn3Q9WUK7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Opn3Q9WUK7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Opn3Q9WUK7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Opn3Q9WUK7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Opn3Q9WUK7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Opn3Q9WUK7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Opn3Q9WUK7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Opn3Q9WUK7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Opn3Q9WUK7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Opn3Q9WUK7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Opn3Q9WUK7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Opn3Q9WUK7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Opn3Q9WUK7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Opn3Q9WUK7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Opn3Q9WUK7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Opn3Q9WUK7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Opn3Q9WUK7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Opn3Q9WUK7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Opn3Q9WUK7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Opn3Q9WUK7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Opn3Q9WUK7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Opn3Q9WUK7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Opn3Q9WUK7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Opn3Q9WUK7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Opn3Q9WUK7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Opn3Q9WUK7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Opn3Q9WUK7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Opn3Q9WUK7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Opn3Q9WUK7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Opn3Q9WUK7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Opn3Q9WUK7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Opn3Q9WUK7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Opn3Q9WUK7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Opn3Q9WUK7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Opn3Q9WUK7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Opn3Q9WUK7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Opn3Q9WUK7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Opn3Q9WUK7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Opn3Q9WUK7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Opn3Q9WUK7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Opn3Q9WUK7 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Opn3Q9WUK7 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Opn3Q9WUK7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Opn3Q9WUK7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Opn3Q9WUK7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Opn3Q9WUK7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Opn3Q9WUK7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Opn3Q9WUK7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Opn3Q9WUK7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Opn3Q9WUK7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Opn3Q9WUK7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Opn3Q9WUK7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Opn3Q9WUK7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Opn3Q9WUK7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Opn3Q9WUK7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Opn3Q9WUK7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Opn3Q9WUK7 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Opn3Q9WUK7 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Opn3Q9WUK7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Opn3Q9WUK7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Opn3Q9WUK7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Opn3Q9WUK7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Opn3Q9WUK7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Opn3Q9WUK7 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Opn3Q9WUK7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Opn3Q9WUK7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Opn3Q9WUK7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Opn3Q9WUK7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Opn3Q9WUK7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Opn3Q9WUK7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Opn3Q9WUK7 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Opn3Q9WUK7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Opn3Q9WUK7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Opn3Q9WUK7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Opn3Q9WUK7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Opn3Q9WUK7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Opn3Q9WUK7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Opn3Q9WUK7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Opn3Q9WUK7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Opn3Q9WUK7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Opn3Q9WUK7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Opn3Q9WUK7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Opn3Q9WUK7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Opn3Q9WUK7 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Opn3Q9WUK7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Opn3Q9WUK7 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms