Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU00

Nrf1, Nuclear respiratory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrf1Q9WU00 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Nrf1Q9WU00 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nrf1Q9WU00 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nrf1Q9WU00 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nrf1Q9WU00 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nrf1Q9WU00 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nrf1Q9WU00 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nrf1Q9WU00 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nrf1Q9WU00 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nrf1Q9WU00 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Nrf1Q9WU00 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nrf1Q9WU00 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nrf1Q9WU00 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nrf1Q9WU00 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nrf1Q9WU00 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nrf1Q9WU00 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nrf1Q9WU00 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nrf1Q9WU00 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nrf1Q9WU00 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nrf1Q9WU00 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nrf1Q9WU00 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nrf1Q9WU00 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nrf1Q9WU00 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nrf1Q9WU00 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nrf1Q9WU00 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nrf1Q9WU00 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nrf1Q9WU00 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nrf1Q9WU00 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nrf1Q9WU00 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nrf1Q9WU00 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nrf1Q9WU00 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nrf1Q9WU00 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nrf1Q9WU00 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nrf1Q9WU00 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nrf1Q9WU00 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nrf1Q9WU00 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Nrf1Q9WU00 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nrf1Q9WU00 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nrf1Q9WU00 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nrf1Q9WU00 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nrf1Q9WU00 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nrf1Q9WU00 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nrf1Q9WU00 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nrf1Q9WU00 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Nrf1Q9WU00 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nrf1Q9WU00 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nrf1Q9WU00 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nrf1Q9WU00 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nrf1Q9WU00 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Nrf1Q9WU00 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nrf1Q9WU00 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nrf1Q9WU00 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nrf1Q9WU00 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nrf1Q9WU00 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nrf1Q9WU00 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nrf1Q9WU00 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nrf1Q9WU00 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nrf1Q9WU00 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nrf1Q9WU00 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nrf1Q9WU00 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nrf1Q9WU00 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nrf1Q9WU00 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nrf1Q9WU00 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nrf1Q9WU00 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nrf1Q9WU00 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nrf1Q9WU00 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nrf1Q9WU00 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nrf1Q9WU00 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nrf1Q9WU00 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nrf1Q9WU00 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nrf1Q9WU00 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nrf1Q9WU00 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nrf1Q9WU00 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nrf1Q9WU00 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nrf1Q9WU00 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nrf1Q9WU00 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nrf1Q9WU00 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nrf1Q9WU00 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nrf1Q9WU00 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nrf1Q9WU00 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nrf1Q9WU00 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nrf1Q9WU00 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nrf1Q9WU00 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nrf1Q9WU00 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nrf1Q9WU00 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nrf1Q9WU00 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nrf1Q9WU00 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nrf1Q9WU00 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nrf1Q9WU00 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nrf1Q9WU00 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nrf1Q9WU00 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nrf1Q9WU00 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nrf1Q9WU00 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nrf1Q9WU00 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nrf1Q9WU00 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nrf1Q9WU00 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nrf1Q9WU00 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nrf1Q9WU00 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nrf1Q9WU00 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nrf1Q9WU00 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms