Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Npas3Q9QZQ0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Npas3Q9QZQ0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Npas3Q9QZQ0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Npas3Q9QZQ0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Npas3Q9QZQ0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Npas3Q9QZQ0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Npas3Q9QZQ0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Npas3Q9QZQ0 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Npas3Q9QZQ0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Npas3Q9QZQ0 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Npas3Q9QZQ0 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Npas3Q9QZQ0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Npas3Q9QZQ0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Npas3Q9QZQ0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Npas3Q9QZQ0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Npas3Q9QZQ0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Npas3Q9QZQ0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Npas3Q9QZQ0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Npas3Q9QZQ0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Npas3Q9QZQ0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Npas3Q9QZQ0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Npas3Q9QZQ0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Npas3Q9QZQ0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Npas3Q9QZQ0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Npas3Q9QZQ0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Npas3Q9QZQ0 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Npas3Q9QZQ0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Npas3Q9QZQ0 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Npas3Q9QZQ0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Npas3Q9QZQ0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Npas3Q9QZQ0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Npas3Q9QZQ0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Npas3Q9QZQ0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Npas3Q9QZQ0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Npas3Q9QZQ0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Npas3Q9QZQ0 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Npas3Q9QZQ0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Npas3Q9QZQ0 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Npas3Q9QZQ0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Npas3Q9QZQ0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Npas3Q9QZQ0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Npas3Q9QZQ0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Npas3Q9QZQ0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Npas3Q9QZQ0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Npas3Q9QZQ0 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Npas3Q9QZQ0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Npas3Q9QZQ0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Npas3Q9QZQ0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Npas3Q9QZQ0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Npas3Q9QZQ0 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Npas3Q9QZQ0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Npas3Q9QZQ0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Npas3Q9QZQ0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Npas3Q9QZQ0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Npas3Q9QZQ0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Npas3Q9QZQ0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Npas3Q9QZQ0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Npas3Q9QZQ0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Npas3Q9QZQ0 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Npas3Q9QZQ0 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Npas3Q9QZQ0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Npas3Q9QZQ0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Npas3Q9QZQ0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Npas3Q9QZQ0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Npas3Q9QZQ0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Npas3Q9QZQ0 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Npas3Q9QZQ0 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Npas3Q9QZQ0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Npas3Q9QZQ0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Npas3Q9QZQ0 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Npas3Q9QZQ0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Npas3Q9QZQ0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Npas3Q9QZQ0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Npas3Q9QZQ0 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Npas3Q9QZQ0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Npas3Q9QZQ0 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Npas3Q9QZQ0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Npas3Q9QZQ0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Npas3Q9QZQ0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Npas3Q9QZQ0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Npas3Q9QZQ0 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Npas3Q9QZQ0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Npas3Q9QZQ0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Npas3Q9QZQ0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Npas3Q9QZQ0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Npas3Q9QZQ0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Npas3Q9QZQ0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Npas3Q9QZQ0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Npas3Q9QZQ0 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Npas3Q9QZQ0 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Npas3Q9QZQ0 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Npas3Q9QZQ0 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Npas3Q9QZQ0 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Npas3Q9QZQ0 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Npas3Q9QZQ0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Npas3Q9QZQ0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Npas3Q9QZQ0 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Npas3Q9QZQ0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Npas3Q9QZQ0 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms