Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ9

Opn4, Melanopsin, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn4Q9QXZ9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Opn4Q9QXZ9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Opn4Q9QXZ9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Opn4Q9QXZ9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Opn4Q9QXZ9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Opn4Q9QXZ9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Opn4Q9QXZ9 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Opn4Q9QXZ9 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Opn4Q9QXZ9 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Opn4Q9QXZ9 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Opn4Q9QXZ9 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Opn4Q9QXZ9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Opn4Q9QXZ9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Opn4Q9QXZ9 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Opn4Q9QXZ9 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Opn4Q9QXZ9 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Opn4Q9QXZ9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Opn4Q9QXZ9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Opn4Q9QXZ9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Opn4Q9QXZ9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Opn4Q9QXZ9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Opn4Q9QXZ9 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Opn4Q9QXZ9 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Opn4Q9QXZ9 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Opn4Q9QXZ9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Opn4Q9QXZ9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Opn4Q9QXZ9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Opn4Q9QXZ9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Opn4Q9QXZ9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Opn4Q9QXZ9 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Opn4Q9QXZ9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Opn4Q9QXZ9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Opn4Q9QXZ9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Opn4Q9QXZ9 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Opn4Q9QXZ9 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Opn4Q9QXZ9 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Opn4Q9QXZ9 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Opn4Q9QXZ9 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Opn4Q9QXZ9 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Opn4Q9QXZ9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Opn4Q9QXZ9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Opn4Q9QXZ9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Opn4Q9QXZ9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Opn4Q9QXZ9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Opn4Q9QXZ9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Opn4Q9QXZ9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Opn4Q9QXZ9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Opn4Q9QXZ9 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Opn4Q9QXZ9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Opn4Q9QXZ9 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Opn4Q9QXZ9 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Opn4Q9QXZ9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Opn4Q9QXZ9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Opn4Q9QXZ9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Opn4Q9QXZ9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Opn4Q9QXZ9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Opn4Q9QXZ9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Opn4Q9QXZ9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Opn4Q9QXZ9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Opn4Q9QXZ9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Opn4Q9QXZ9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Opn4Q9QXZ9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Opn4Q9QXZ9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Opn4Q9QXZ9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Opn4Q9QXZ9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Opn4Q9QXZ9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Opn4Q9QXZ9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Opn4Q9QXZ9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Opn4Q9QXZ9 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Opn4Q9QXZ9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Opn4Q9QXZ9 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Opn4Q9QXZ9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Opn4Q9QXZ9 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Opn4Q9QXZ9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Opn4Q9QXZ9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Opn4Q9QXZ9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Opn4Q9QXZ9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Opn4Q9QXZ9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Opn4Q9QXZ9 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Opn4Q9QXZ9 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Opn4Q9QXZ9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Opn4Q9QXZ9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Opn4Q9QXZ9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Opn4Q9QXZ9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Opn4Q9QXZ9 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Opn4Q9QXZ9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Opn4Q9QXZ9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Opn4Q9QXZ9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Opn4Q9QXZ9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Opn4Q9QXZ9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Opn4Q9QXZ9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Opn4Q9QXZ9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Opn4Q9QXZ9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Opn4Q9QXZ9 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Opn4Q9QXZ9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Opn4Q9QXZ9 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Opn4Q9QXZ9 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Opn4Q9QXZ9 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Opn4Q9QXZ9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Opn4Q9QXZ9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms