Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXX8

Nufip1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nufip1Q9QXX8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nufip1Q9QXX8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nufip1Q9QXX8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nufip1Q9QXX8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nufip1Q9QXX8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nufip1Q9QXX8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nufip1Q9QXX8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nufip1Q9QXX8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nufip1Q9QXX8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nufip1Q9QXX8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nufip1Q9QXX8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nufip1Q9QXX8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Nufip1Q9QXX8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nufip1Q9QXX8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nufip1Q9QXX8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nufip1Q9QXX8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nufip1Q9QXX8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nufip1Q9QXX8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Nufip1Q9QXX8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Nufip1Q9QXX8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nufip1Q9QXX8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nufip1Q9QXX8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nufip1Q9QXX8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nufip1Q9QXX8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nufip1Q9QXX8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nufip1Q9QXX8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nufip1Q9QXX8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nufip1Q9QXX8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nufip1Q9QXX8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nufip1Q9QXX8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nufip1Q9QXX8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Nufip1Q9QXX8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Nufip1Q9QXX8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nufip1Q9QXX8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nufip1Q9QXX8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nufip1Q9QXX8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nufip1Q9QXX8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nufip1Q9QXX8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nufip1Q9QXX8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nufip1Q9QXX8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nufip1Q9QXX8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nufip1Q9QXX8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nufip1Q9QXX8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nufip1Q9QXX8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nufip1Q9QXX8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Nufip1Q9QXX8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nufip1Q9QXX8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nufip1Q9QXX8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nufip1Q9QXX8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nufip1Q9QXX8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nufip1Q9QXX8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nufip1Q9QXX8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nufip1Q9QXX8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nufip1Q9QXX8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Nufip1Q9QXX8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nufip1Q9QXX8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nufip1Q9QXX8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nufip1Q9QXX8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nufip1Q9QXX8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nufip1Q9QXX8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Nufip1Q9QXX8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nufip1Q9QXX8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nufip1Q9QXX8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nufip1Q9QXX8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nufip1Q9QXX8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Nufip1Q9QXX8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nufip1Q9QXX8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Nufip1Q9QXX8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Nufip1Q9QXX8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Nufip1Q9QXX8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nufip1Q9QXX8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nufip1Q9QXX8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nufip1Q9QXX8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nufip1Q9QXX8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nufip1Q9QXX8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nufip1Q9QXX8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nufip1Q9QXX8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nufip1Q9QXX8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nufip1Q9QXX8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nufip1Q9QXX8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nufip1Q9QXX8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nufip1Q9QXX8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nufip1Q9QXX8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nufip1Q9QXX8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nufip1Q9QXX8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nufip1Q9QXX8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nufip1Q9QXX8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nufip1Q9QXX8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nufip1Q9QXX8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nufip1Q9QXX8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nufip1Q9QXX8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nufip1Q9QXX8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nufip1Q9QXX8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Nufip1Q9QXX8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nufip1Q9QXX8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nufip1Q9QXX8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nufip1Q9QXX8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nufip1Q9QXX8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nufip1Q9QXX8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nufip1Q9QXX8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms