Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnip3Q9QXT8 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnip3Q9QXT8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnip3Q9QXT8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnip3Q9QXT8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnip3Q9QXT8 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnip3Q9QXT8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnip3Q9QXT8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnip3Q9QXT8 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnip3Q9QXT8 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnip3Q9QXT8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnip3Q9QXT8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnip3Q9QXT8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnip3Q9QXT8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnip3Q9QXT8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnip3Q9QXT8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnip3Q9QXT8 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnip3Q9QXT8 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnip3Q9QXT8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnip3Q9QXT8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnip3Q9QXT8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnip3Q9QXT8 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnip3Q9QXT8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnip3Q9QXT8 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnip3Q9QXT8 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnip3Q9QXT8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnip3Q9QXT8 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnip3Q9QXT8 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnip3Q9QXT8 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnip3Q9QXT8 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnip3Q9QXT8 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnip3Q9QXT8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnip3Q9QXT8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnip3Q9QXT8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnip3Q9QXT8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnip3Q9QXT8 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnip3Q9QXT8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnip3Q9QXT8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnip3Q9QXT8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnip3Q9QXT8 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnip3Q9QXT8 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnip3Q9QXT8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnip3Q9QXT8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnip3Q9QXT8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnip3Q9QXT8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnip3Q9QXT8 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnip3Q9QXT8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnip3Q9QXT8 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnip3Q9QXT8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnip3Q9QXT8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnip3Q9QXT8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnip3Q9QXT8 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnip3Q9QXT8 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnip3Q9QXT8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnip3Q9QXT8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnip3Q9QXT8 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnip3Q9QXT8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnip3Q9QXT8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnip3Q9QXT8 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnip3Q9QXT8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnip3Q9QXT8 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnip3Q9QXT8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnip3Q9QXT8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnip3Q9QXT8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnip3Q9QXT8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnip3Q9QXT8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnip3Q9QXT8 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnip3Q9QXT8 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnip3Q9QXT8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnip3Q9QXT8 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnip3Q9QXT8 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnip3Q9QXT8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnip3Q9QXT8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnip3Q9QXT8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnip3Q9QXT8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnip3Q9QXT8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnip3Q9QXT8 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnip3Q9QXT8 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnip3Q9QXT8 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnip3Q9QXT8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnip3Q9QXT8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnip3Q9QXT8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnip3Q9QXT8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnip3Q9QXT8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnip3Q9QXT8 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnip3Q9QXT8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnip3Q9QXT8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnip3Q9QXT8 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnip3Q9QXT8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnip3Q9QXT8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnip3Q9QXT8 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnip3Q9QXT8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnip3Q9QXT8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnip3Q9QXT8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnip3Q9QXT8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnip3Q9QXT8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnip3Q9QXT8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnip3Q9QXT8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnip3Q9QXT8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnip3Q9QXT8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms