Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVN7

Tcea2, Transcription elongation factor A protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcea2Q9QVN7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tcea2Q9QVN7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tcea2Q9QVN7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tcea2Q9QVN7 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tcea2Q9QVN7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tcea2Q9QVN7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tcea2Q9QVN7 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tcea2Q9QVN7 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tcea2Q9QVN7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tcea2Q9QVN7 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tcea2Q9QVN7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tcea2Q9QVN7 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tcea2Q9QVN7 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Tcea2Q9QVN7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tcea2Q9QVN7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tcea2Q9QVN7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tcea2Q9QVN7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tcea2Q9QVN7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tcea2Q9QVN7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tcea2Q9QVN7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tcea2Q9QVN7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tcea2Q9QVN7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tcea2Q9QVN7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Tcea2Q9QVN7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tcea2Q9QVN7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tcea2Q9QVN7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tcea2Q9QVN7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tcea2Q9QVN7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tcea2Q9QVN7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tcea2Q9QVN7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tcea2Q9QVN7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tcea2Q9QVN7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tcea2Q9QVN7 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tcea2Q9QVN7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tcea2Q9QVN7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tcea2Q9QVN7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tcea2Q9QVN7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tcea2Q9QVN7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tcea2Q9QVN7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tcea2Q9QVN7 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tcea2Q9QVN7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tcea2Q9QVN7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tcea2Q9QVN7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tcea2Q9QVN7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tcea2Q9QVN7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tcea2Q9QVN7 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tcea2Q9QVN7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tcea2Q9QVN7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tcea2Q9QVN7 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Tcea2Q9QVN7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tcea2Q9QVN7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tcea2Q9QVN7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tcea2Q9QVN7 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tcea2Q9QVN7 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tcea2Q9QVN7 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tcea2Q9QVN7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tcea2Q9QVN7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tcea2Q9QVN7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tcea2Q9QVN7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tcea2Q9QVN7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tcea2Q9QVN7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tcea2Q9QVN7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tcea2Q9QVN7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tcea2Q9QVN7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tcea2Q9QVN7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tcea2Q9QVN7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tcea2Q9QVN7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tcea2Q9QVN7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tcea2Q9QVN7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tcea2Q9QVN7 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tcea2Q9QVN7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tcea2Q9QVN7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tcea2Q9QVN7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tcea2Q9QVN7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tcea2Q9QVN7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tcea2Q9QVN7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tcea2Q9QVN7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tcea2Q9QVN7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tcea2Q9QVN7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tcea2Q9QVN7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tcea2Q9QVN7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tcea2Q9QVN7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tcea2Q9QVN7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tcea2Q9QVN7 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tcea2Q9QVN7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tcea2Q9QVN7 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tcea2Q9QVN7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tcea2Q9QVN7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tcea2Q9QVN7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tcea2Q9QVN7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tcea2Q9QVN7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tcea2Q9QVN7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tcea2Q9QVN7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tcea2Q9QVN7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tcea2Q9QVN7 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tcea2Q9QVN7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tcea2Q9QVN7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tcea2Q9QVN7 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tcea2Q9QVN7 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tcea2Q9QVN7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms