Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUG2

Polk, DNA polymerase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolkQ9QUG2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PolkQ9QUG2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PolkQ9QUG2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PolkQ9QUG2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PolkQ9QUG2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PolkQ9QUG2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PolkQ9QUG2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PolkQ9QUG2 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PolkQ9QUG2 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PolkQ9QUG2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PolkQ9QUG2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PolkQ9QUG2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PolkQ9QUG2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PolkQ9QUG2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PolkQ9QUG2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PolkQ9QUG2 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PolkQ9QUG2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PolkQ9QUG2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PolkQ9QUG2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PolkQ9QUG2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PolkQ9QUG2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PolkQ9QUG2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PolkQ9QUG2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PolkQ9QUG2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PolkQ9QUG2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PolkQ9QUG2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PolkQ9QUG2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PolkQ9QUG2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PolkQ9QUG2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PolkQ9QUG2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PolkQ9QUG2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PolkQ9QUG2 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PolkQ9QUG2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PolkQ9QUG2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PolkQ9QUG2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PolkQ9QUG2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PolkQ9QUG2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
PolkQ9QUG2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PolkQ9QUG2 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PolkQ9QUG2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PolkQ9QUG2 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PolkQ9QUG2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PolkQ9QUG2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PolkQ9QUG2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PolkQ9QUG2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PolkQ9QUG2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PolkQ9QUG2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PolkQ9QUG2 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PolkQ9QUG2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PolkQ9QUG2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PolkQ9QUG2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PolkQ9QUG2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PolkQ9QUG2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PolkQ9QUG2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PolkQ9QUG2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PolkQ9QUG2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PolkQ9QUG2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PolkQ9QUG2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PolkQ9QUG2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PolkQ9QUG2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PolkQ9QUG2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PolkQ9QUG2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PolkQ9QUG2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PolkQ9QUG2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PolkQ9QUG2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PolkQ9QUG2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PolkQ9QUG2 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PolkQ9QUG2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PolkQ9QUG2 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PolkQ9QUG2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PolkQ9QUG2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PolkQ9QUG2 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PolkQ9QUG2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PolkQ9QUG2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PolkQ9QUG2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PolkQ9QUG2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PolkQ9QUG2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PolkQ9QUG2 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PolkQ9QUG2 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PolkQ9QUG2 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PolkQ9QUG2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PolkQ9QUG2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PolkQ9QUG2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PolkQ9QUG2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PolkQ9QUG2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PolkQ9QUG2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PolkQ9QUG2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PolkQ9QUG2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PolkQ9QUG2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PolkQ9QUG2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PolkQ9QUG2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PolkQ9QUG2 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PolkQ9QUG2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PolkQ9QUG2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PolkQ9QUG2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PolkQ9QUG2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PolkQ9QUG2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PolkQ9QUG2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PolkQ9QUG2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PolkQ9QUG2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms