Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rabgef1Q9JM13 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rabgef1Q9JM13 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rabgef1Q9JM13 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rabgef1Q9JM13 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rabgef1Q9JM13 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rabgef1Q9JM13 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rabgef1Q9JM13 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rabgef1Q9JM13 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rabgef1Q9JM13 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rabgef1Q9JM13 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rabgef1Q9JM13 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rabgef1Q9JM13 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rabgef1Q9JM13 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rabgef1Q9JM13 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rabgef1Q9JM13 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rabgef1Q9JM13 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rabgef1Q9JM13 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rabgef1Q9JM13 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rabgef1Q9JM13 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rabgef1Q9JM13 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rabgef1Q9JM13 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rabgef1Q9JM13 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rabgef1Q9JM13 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rabgef1Q9JM13 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rabgef1Q9JM13 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rabgef1Q9JM13 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rabgef1Q9JM13 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Rabgef1Q9JM13 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rabgef1Q9JM13 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rabgef1Q9JM13 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rabgef1Q9JM13 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rabgef1Q9JM13 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rabgef1Q9JM13 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rabgef1Q9JM13 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rabgef1Q9JM13 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rabgef1Q9JM13 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rabgef1Q9JM13 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rabgef1Q9JM13 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rabgef1Q9JM13 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rabgef1Q9JM13 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rabgef1Q9JM13 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rabgef1Q9JM13 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rabgef1Q9JM13 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rabgef1Q9JM13 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rabgef1Q9JM13 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rabgef1Q9JM13 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Rabgef1Q9JM13 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rabgef1Q9JM13 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rabgef1Q9JM13 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rabgef1Q9JM13 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rabgef1Q9JM13 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rabgef1Q9JM13 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Rabgef1Q9JM13 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Rabgef1Q9JM13 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rabgef1Q9JM13 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rabgef1Q9JM13 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Rabgef1Q9JM13 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rabgef1Q9JM13 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rabgef1Q9JM13 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rabgef1Q9JM13 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rabgef1Q9JM13 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rabgef1Q9JM13 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rabgef1Q9JM13 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rabgef1Q9JM13 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rabgef1Q9JM13 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rabgef1Q9JM13 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rabgef1Q9JM13 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rabgef1Q9JM13 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rabgef1Q9JM13 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rabgef1Q9JM13 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rabgef1Q9JM13 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rabgef1Q9JM13 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rabgef1Q9JM13 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rabgef1Q9JM13 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rabgef1Q9JM13 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rabgef1Q9JM13 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rabgef1Q9JM13 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rabgef1Q9JM13 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rabgef1Q9JM13 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rabgef1Q9JM13 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rabgef1Q9JM13 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rabgef1Q9JM13 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Rabgef1Q9JM13 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rabgef1Q9JM13 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rabgef1Q9JM13 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rabgef1Q9JM13 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rabgef1Q9JM13 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rabgef1Q9JM13 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rabgef1Q9JM13 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rabgef1Q9JM13 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rabgef1Q9JM13 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rabgef1Q9JM13 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rabgef1Q9JM13 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rabgef1Q9JM13 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rabgef1Q9JM13 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rabgef1Q9JM13 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rabgef1Q9JM13 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rabgef1Q9JM13 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
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