Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC6

Tef, Thyrotroph embryonic factor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefQ9JLC6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TefQ9JLC6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TefQ9JLC6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TefQ9JLC6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TefQ9JLC6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TefQ9JLC6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TefQ9JLC6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TefQ9JLC6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TefQ9JLC6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TefQ9JLC6 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TefQ9JLC6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TefQ9JLC6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TefQ9JLC6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TefQ9JLC6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TefQ9JLC6 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TefQ9JLC6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TefQ9JLC6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TefQ9JLC6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TefQ9JLC6 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TefQ9JLC6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TefQ9JLC6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TefQ9JLC6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TefQ9JLC6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TefQ9JLC6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TefQ9JLC6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TefQ9JLC6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TefQ9JLC6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TefQ9JLC6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TefQ9JLC6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TefQ9JLC6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TefQ9JLC6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TefQ9JLC6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TefQ9JLC6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TefQ9JLC6 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TefQ9JLC6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TefQ9JLC6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TefQ9JLC6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TefQ9JLC6 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TefQ9JLC6 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TefQ9JLC6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TefQ9JLC6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TefQ9JLC6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TefQ9JLC6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TefQ9JLC6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TefQ9JLC6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TefQ9JLC6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TefQ9JLC6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TefQ9JLC6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TefQ9JLC6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TefQ9JLC6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TefQ9JLC6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TefQ9JLC6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TefQ9JLC6 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TefQ9JLC6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TefQ9JLC6 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TefQ9JLC6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TefQ9JLC6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TefQ9JLC6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TefQ9JLC6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TefQ9JLC6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TefQ9JLC6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TefQ9JLC6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TefQ9JLC6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TefQ9JLC6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TefQ9JLC6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TefQ9JLC6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TefQ9JLC6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TefQ9JLC6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TefQ9JLC6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TefQ9JLC6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TefQ9JLC6 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TefQ9JLC6 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TefQ9JLC6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TefQ9JLC6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TefQ9JLC6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TefQ9JLC6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TefQ9JLC6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TefQ9JLC6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TefQ9JLC6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TefQ9JLC6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TefQ9JLC6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TefQ9JLC6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TefQ9JLC6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TefQ9JLC6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TefQ9JLC6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TefQ9JLC6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TefQ9JLC6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TefQ9JLC6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TefQ9JLC6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TefQ9JLC6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TefQ9JLC6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TefQ9JLC6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TefQ9JLC6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TefQ9JLC6 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TefQ9JLC6 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TefQ9JLC6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TefQ9JLC6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TefQ9JLC6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TefQ9JLC6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TefQ9JLC6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms