Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV5

Scamp4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp4Q9JKV5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Scamp4Q9JKV5 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Scamp4Q9JKV5 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Scamp4Q9JKV5 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Scamp4Q9JKV5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Scamp4Q9JKV5 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Scamp4Q9JKV5 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Scamp4Q9JKV5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Scamp4Q9JKV5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Scamp4Q9JKV5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Scamp4Q9JKV5 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Scamp4Q9JKV5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Scamp4Q9JKV5 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Scamp4Q9JKV5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Scamp4Q9JKV5 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Scamp4Q9JKV5 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Scamp4Q9JKV5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Scamp4Q9JKV5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Scamp4Q9JKV5 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Scamp4Q9JKV5 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Scamp4Q9JKV5 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Scamp4Q9JKV5 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Scamp4Q9JKV5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Scamp4Q9JKV5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Scamp4Q9JKV5 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Scamp4Q9JKV5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Scamp4Q9JKV5 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Scamp4Q9JKV5 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Scamp4Q9JKV5 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Scamp4Q9JKV5 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Scamp4Q9JKV5 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Scamp4Q9JKV5 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Scamp4Q9JKV5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Scamp4Q9JKV5 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Scamp4Q9JKV5 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Scamp4Q9JKV5 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Scamp4Q9JKV5 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Scamp4Q9JKV5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Scamp4Q9JKV5 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Scamp4Q9JKV5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Scamp4Q9JKV5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Scamp4Q9JKV5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Scamp4Q9JKV5 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Scamp4Q9JKV5 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Scamp4Q9JKV5 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Scamp4Q9JKV5 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Scamp4Q9JKV5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Scamp4Q9JKV5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Scamp4Q9JKV5 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Scamp4Q9JKV5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Scamp4Q9JKV5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Scamp4Q9JKV5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Scamp4Q9JKV5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Scamp4Q9JKV5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Scamp4Q9JKV5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Scamp4Q9JKV5 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Scamp4Q9JKV5 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Scamp4Q9JKV5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Scamp4Q9JKV5 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Scamp4Q9JKV5 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Scamp4Q9JKV5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Scamp4Q9JKV5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Scamp4Q9JKV5 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Scamp4Q9JKV5 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Scamp4Q9JKV5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Scamp4Q9JKV5 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Scamp4Q9JKV5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Scamp4Q9JKV5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Scamp4Q9JKV5 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Scamp4Q9JKV5 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Scamp4Q9JKV5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Scamp4Q9JKV5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Scamp4Q9JKV5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Scamp4Q9JKV5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Scamp4Q9JKV5 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Scamp4Q9JKV5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Scamp4Q9JKV5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Scamp4Q9JKV5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Scamp4Q9JKV5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Scamp4Q9JKV5 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Scamp4Q9JKV5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Scamp4Q9JKV5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Scamp4Q9JKV5 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Scamp4Q9JKV5 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Scamp4Q9JKV5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Scamp4Q9JKV5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Scamp4Q9JKV5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Scamp4Q9JKV5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Scamp4Q9JKV5 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Scamp4Q9JKV5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Scamp4Q9JKV5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Scamp4Q9JKV5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Scamp4Q9JKV5 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Scamp4Q9JKV5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Scamp4Q9JKV5 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Scamp4Q9JKV5 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Scamp4Q9JKV5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Scamp4Q9JKV5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Scamp4Q9JKV5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Scamp4Q9JKV5 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms