Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP7

Pole3, DNA polymerase epsilon subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole3Q9JKP7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pole3Q9JKP7 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pole3Q9JKP7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pole3Q9JKP7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pole3Q9JKP7 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pole3Q9JKP7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pole3Q9JKP7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pole3Q9JKP7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pole3Q9JKP7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pole3Q9JKP7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Pole3Q9JKP7 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pole3Q9JKP7 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pole3Q9JKP7 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pole3Q9JKP7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pole3Q9JKP7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pole3Q9JKP7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Pole3Q9JKP7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Pole3Q9JKP7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pole3Q9JKP7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pole3Q9JKP7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pole3Q9JKP7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pole3Q9JKP7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pole3Q9JKP7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pole3Q9JKP7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pole3Q9JKP7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pole3Q9JKP7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pole3Q9JKP7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pole3Q9JKP7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pole3Q9JKP7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pole3Q9JKP7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pole3Q9JKP7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pole3Q9JKP7 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pole3Q9JKP7 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pole3Q9JKP7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pole3Q9JKP7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pole3Q9JKP7 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pole3Q9JKP7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pole3Q9JKP7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Pole3Q9JKP7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pole3Q9JKP7 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pole3Q9JKP7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pole3Q9JKP7 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pole3Q9JKP7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pole3Q9JKP7 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pole3Q9JKP7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pole3Q9JKP7 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pole3Q9JKP7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pole3Q9JKP7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pole3Q9JKP7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pole3Q9JKP7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pole3Q9JKP7 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pole3Q9JKP7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pole3Q9JKP7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pole3Q9JKP7 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Pole3Q9JKP7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pole3Q9JKP7 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pole3Q9JKP7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pole3Q9JKP7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pole3Q9JKP7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pole3Q9JKP7 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pole3Q9JKP7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pole3Q9JKP7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pole3Q9JKP7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pole3Q9JKP7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pole3Q9JKP7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pole3Q9JKP7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pole3Q9JKP7 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pole3Q9JKP7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pole3Q9JKP7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pole3Q9JKP7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pole3Q9JKP7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pole3Q9JKP7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pole3Q9JKP7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pole3Q9JKP7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pole3Q9JKP7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pole3Q9JKP7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pole3Q9JKP7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pole3Q9JKP7 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pole3Q9JKP7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pole3Q9JKP7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pole3Q9JKP7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pole3Q9JKP7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pole3Q9JKP7 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pole3Q9JKP7 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pole3Q9JKP7 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pole3Q9JKP7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pole3Q9JKP7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pole3Q9JKP7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pole3Q9JKP7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pole3Q9JKP7 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pole3Q9JKP7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pole3Q9JKP7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pole3Q9JKP7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pole3Q9JKP7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pole3Q9JKP7 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pole3Q9JKP7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pole3Q9JKP7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pole3Q9JKP7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pole3Q9JKP7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pole3Q9JKP7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms