Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Riox1Q9JJF3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Riox1Q9JJF3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Riox1Q9JJF3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Riox1Q9JJF3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Riox1Q9JJF3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Riox1Q9JJF3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Riox1Q9JJF3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Riox1Q9JJF3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Riox1Q9JJF3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Riox1Q9JJF3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Riox1Q9JJF3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Riox1Q9JJF3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Riox1Q9JJF3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Riox1Q9JJF3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Riox1Q9JJF3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Riox1Q9JJF3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Riox1Q9JJF3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Riox1Q9JJF3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Riox1Q9JJF3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Riox1Q9JJF3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Riox1Q9JJF3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Riox1Q9JJF3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Riox1Q9JJF3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Riox1Q9JJF3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Riox1Q9JJF3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Riox1Q9JJF3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Riox1Q9JJF3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Riox1Q9JJF3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Riox1Q9JJF3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Riox1Q9JJF3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Riox1Q9JJF3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Riox1Q9JJF3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Riox1Q9JJF3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Riox1Q9JJF3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Riox1Q9JJF3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Riox1Q9JJF3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Riox1Q9JJF3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Riox1Q9JJF3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Riox1Q9JJF3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Riox1Q9JJF3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Riox1Q9JJF3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Riox1Q9JJF3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Riox1Q9JJF3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Riox1Q9JJF3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Riox1Q9JJF3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Riox1Q9JJF3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Riox1Q9JJF3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Riox1Q9JJF3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Riox1Q9JJF3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Riox1Q9JJF3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Riox1Q9JJF3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Riox1Q9JJF3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Riox1Q9JJF3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Riox1Q9JJF3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Riox1Q9JJF3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Riox1Q9JJF3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Riox1Q9JJF3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Riox1Q9JJF3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Riox1Q9JJF3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Riox1Q9JJF3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Riox1Q9JJF3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Riox1Q9JJF3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Riox1Q9JJF3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Riox1Q9JJF3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Riox1Q9JJF3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Riox1Q9JJF3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Riox1Q9JJF3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Riox1Q9JJF3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Riox1Q9JJF3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Riox1Q9JJF3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Riox1Q9JJF3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Riox1Q9JJF3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Riox1Q9JJF3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Riox1Q9JJF3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Riox1Q9JJF3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Riox1Q9JJF3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Riox1Q9JJF3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Riox1Q9JJF3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Riox1Q9JJF3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Riox1Q9JJF3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Riox1Q9JJF3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Riox1Q9JJF3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Riox1Q9JJF3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Riox1Q9JJF3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Riox1Q9JJF3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Riox1Q9JJF3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Riox1Q9JJF3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Riox1Q9JJF3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Riox1Q9JJF3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Riox1Q9JJF3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Riox1Q9JJF3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Riox1Q9JJF3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Riox1Q9JJF3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Riox1Q9JJF3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Riox1Q9JJF3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Riox1Q9JJF3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Riox1Q9JJF3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Riox1Q9JJF3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Riox1Q9JJF3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms