Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RabggtaQ9JHK4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RabggtaQ9JHK4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RabggtaQ9JHK4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RabggtaQ9JHK4 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RabggtaQ9JHK4 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RabggtaQ9JHK4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RabggtaQ9JHK4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RabggtaQ9JHK4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RabggtaQ9JHK4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RabggtaQ9JHK4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RabggtaQ9JHK4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RabggtaQ9JHK4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RabggtaQ9JHK4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RabggtaQ9JHK4 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RabggtaQ9JHK4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RabggtaQ9JHK4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RabggtaQ9JHK4 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RabggtaQ9JHK4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RabggtaQ9JHK4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RabggtaQ9JHK4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RabggtaQ9JHK4 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RabggtaQ9JHK4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RabggtaQ9JHK4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RabggtaQ9JHK4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RabggtaQ9JHK4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RabggtaQ9JHK4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RabggtaQ9JHK4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RabggtaQ9JHK4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RabggtaQ9JHK4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RabggtaQ9JHK4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RabggtaQ9JHK4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RabggtaQ9JHK4 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RabggtaQ9JHK4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RabggtaQ9JHK4 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RabggtaQ9JHK4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RabggtaQ9JHK4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RabggtaQ9JHK4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RabggtaQ9JHK4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RabggtaQ9JHK4 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RabggtaQ9JHK4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RabggtaQ9JHK4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RabggtaQ9JHK4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RabggtaQ9JHK4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RabggtaQ9JHK4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RabggtaQ9JHK4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RabggtaQ9JHK4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RabggtaQ9JHK4 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RabggtaQ9JHK4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RabggtaQ9JHK4 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RabggtaQ9JHK4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RabggtaQ9JHK4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RabggtaQ9JHK4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RabggtaQ9JHK4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RabggtaQ9JHK4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RabggtaQ9JHK4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RabggtaQ9JHK4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RabggtaQ9JHK4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RabggtaQ9JHK4 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RabggtaQ9JHK4 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RabggtaQ9JHK4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RabggtaQ9JHK4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RabggtaQ9JHK4 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RabggtaQ9JHK4 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RabggtaQ9JHK4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RabggtaQ9JHK4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RabggtaQ9JHK4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RabggtaQ9JHK4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RabggtaQ9JHK4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RabggtaQ9JHK4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RabggtaQ9JHK4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RabggtaQ9JHK4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RabggtaQ9JHK4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RabggtaQ9JHK4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RabggtaQ9JHK4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RabggtaQ9JHK4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RabggtaQ9JHK4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RabggtaQ9JHK4 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RabggtaQ9JHK4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RabggtaQ9JHK4 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RabggtaQ9JHK4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RabggtaQ9JHK4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RabggtaQ9JHK4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RabggtaQ9JHK4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RabggtaQ9JHK4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RabggtaQ9JHK4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RabggtaQ9JHK4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RabggtaQ9JHK4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RabggtaQ9JHK4 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RabggtaQ9JHK4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RabggtaQ9JHK4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RabggtaQ9JHK4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RabggtaQ9JHK4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RabggtaQ9JHK4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RabggtaQ9JHK4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RabggtaQ9JHK4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RabggtaQ9JHK4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RabggtaQ9JHK4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RabggtaQ9JHK4 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RabggtaQ9JHK4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
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