Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESX2

Sp6, Transcription factor Sp6, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp6Q9ESX2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sp6Q9ESX2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sp6Q9ESX2 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sp6Q9ESX2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sp6Q9ESX2 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sp6Q9ESX2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sp6Q9ESX2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sp6Q9ESX2 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sp6Q9ESX2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sp6Q9ESX2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sp6Q9ESX2 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sp6Q9ESX2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sp6Q9ESX2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sp6Q9ESX2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sp6Q9ESX2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sp6Q9ESX2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sp6Q9ESX2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sp6Q9ESX2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sp6Q9ESX2 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sp6Q9ESX2 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sp6Q9ESX2 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sp6Q9ESX2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sp6Q9ESX2 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sp6Q9ESX2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sp6Q9ESX2 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sp6Q9ESX2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sp6Q9ESX2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sp6Q9ESX2 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sp6Q9ESX2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sp6Q9ESX2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sp6Q9ESX2 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sp6Q9ESX2 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sp6Q9ESX2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sp6Q9ESX2 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sp6Q9ESX2 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sp6Q9ESX2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sp6Q9ESX2 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sp6Q9ESX2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sp6Q9ESX2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sp6Q9ESX2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sp6Q9ESX2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sp6Q9ESX2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sp6Q9ESX2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sp6Q9ESX2 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sp6Q9ESX2 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sp6Q9ESX2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sp6Q9ESX2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sp6Q9ESX2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sp6Q9ESX2 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sp6Q9ESX2 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sp6Q9ESX2 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sp6Q9ESX2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sp6Q9ESX2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sp6Q9ESX2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sp6Q9ESX2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sp6Q9ESX2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sp6Q9ESX2 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sp6Q9ESX2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sp6Q9ESX2 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sp6Q9ESX2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sp6Q9ESX2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sp6Q9ESX2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sp6Q9ESX2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sp6Q9ESX2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sp6Q9ESX2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sp6Q9ESX2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sp6Q9ESX2 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sp6Q9ESX2 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sp6Q9ESX2 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sp6Q9ESX2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sp6Q9ESX2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sp6Q9ESX2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sp6Q9ESX2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sp6Q9ESX2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sp6Q9ESX2 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sp6Q9ESX2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sp6Q9ESX2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sp6Q9ESX2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sp6Q9ESX2 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sp6Q9ESX2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sp6Q9ESX2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sp6Q9ESX2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sp6Q9ESX2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sp6Q9ESX2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sp6Q9ESX2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sp6Q9ESX2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sp6Q9ESX2 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sp6Q9ESX2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sp6Q9ESX2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sp6Q9ESX2 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sp6Q9ESX2 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sp6Q9ESX2 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sp6Q9ESX2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sp6Q9ESX2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sp6Q9ESX2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sp6Q9ESX2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sp6Q9ESX2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sp6Q9ESX2 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sp6Q9ESX2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sp6Q9ESX2 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms