Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESU6

Brd4, Bromodomain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd4Q9ESU6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Brd4Q9ESU6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Brd4Q9ESU6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Brd4Q9ESU6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Brd4Q9ESU6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Brd4Q9ESU6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Brd4Q9ESU6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
Brd4Q9ESU6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Brd4Q9ESU6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Brd4Q9ESU6 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Brd4Q9ESU6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Brd4Q9ESU6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Brd4Q9ESU6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Brd4Q9ESU6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Brd4Q9ESU6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
Brd4Q9ESU6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Brd4Q9ESU6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Brd4Q9ESU6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Brd4Q9ESU6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Brd4Q9ESU6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Brd4Q9ESU6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Brd4Q9ESU6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Brd4Q9ESU6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Brd4Q9ESU6 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Brd4Q9ESU6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Brd4Q9ESU6 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Brd4Q9ESU6 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Brd4Q9ESU6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Brd4Q9ESU6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Brd4Q9ESU6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Brd4Q9ESU6 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Brd4Q9ESU6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Brd4Q9ESU6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Brd4Q9ESU6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Brd4Q9ESU6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Brd4Q9ESU6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Brd4Q9ESU6 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Brd4Q9ESU6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Brd4Q9ESU6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Brd4Q9ESU6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Brd4Q9ESU6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Brd4Q9ESU6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Brd4Q9ESU6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Brd4Q9ESU6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Brd4Q9ESU6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Brd4Q9ESU6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Brd4Q9ESU6 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
Brd4Q9ESU6 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Brd4Q9ESU6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Brd4Q9ESU6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Brd4Q9ESU6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Brd4Q9ESU6 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
Brd4Q9ESU6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Brd4Q9ESU6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
Brd4Q9ESU6 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Brd4Q9ESU6 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Brd4Q9ESU6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Brd4Q9ESU6 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Brd4Q9ESU6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Brd4Q9ESU6 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Brd4Q9ESU6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Brd4Q9ESU6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Brd4Q9ESU6 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Brd4Q9ESU6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Brd4Q9ESU6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Brd4Q9ESU6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Brd4Q9ESU6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Brd4Q9ESU6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Brd4Q9ESU6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Brd4Q9ESU6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Brd4Q9ESU6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Brd4Q9ESU6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Brd4Q9ESU6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Brd4Q9ESU6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Brd4Q9ESU6 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Brd4Q9ESU6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Brd4Q9ESU6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Brd4Q9ESU6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Brd4Q9ESU6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Brd4Q9ESU6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Brd4Q9ESU6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Brd4Q9ESU6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Brd4Q9ESU6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Brd4Q9ESU6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
Brd4Q9ESU6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Brd4Q9ESU6 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
Brd4Q9ESU6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Brd4Q9ESU6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Brd4Q9ESU6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Brd4Q9ESU6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Brd4Q9ESU6 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Brd4Q9ESU6 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Brd4Q9ESU6 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Brd4Q9ESU6 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
Brd4Q9ESU6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Brd4Q9ESU6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Brd4Q9ESU6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Brd4Q9ESU6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Brd4Q9ESU6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Brd4Q9ESU6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.3 ms